Служба сельскохозяйственных исследований Министерства сельского хозяйства США объявила, что её исследователи сократили количество штаммов вируса африканской чумы свиней с 25 до шести уникальных генотипов. Работа может облегчить разработку вакцин, соответствующих различным штаммам, циркулирующих в эндемичных районах по всему миру.
Ранее во всём мире было идентифицировано 25 различных генотипов вируса. Наша исследовательская группа недавно провела повторную оценку всех общедоступных последовательностей ДНК вируса и обнаружила, что большинство генотипов, первоначально описанных как новые, не были правильно идентифицированы и не сравнивались с уже существующими генотипами вируса. На самом деле уникальных генотипов меньше, чем полагало научное сообщество, а это означает, что существует меньшее разнообразие вируса, поражающего животных по всему миру,
- отметил старший научный сотрудник Минсельхоза США Дуглас Глэдью.
В ходе крупномасштабной работы исследователи повторно проанализировали более 12 000 исторических и текущих изолятов вируса, полученных в лабораториях по всему миру. Эти усилия стали возможными благодаря использованию вычислительных мощностей SciNet, суперкомпьютерного кластера для решения проблем с большими данными в сельском хозяйстве.
Точная классификация вирусов имеет первостепенное значение для эпидемиологических исследований и разработки экономически эффективных контрмер, включая разработку вакцин для уникальных штаммов вируса африканской чумы свиней.
Высокозаразный вирус, который наносит огромный экономический ущерб мировой свиноводческой отрасли, был принесён из Африки в Грузию в 2007 году и с тех пор распространился по Европе и Азии, прежде чем достичь Южной Африки в начале 2023 года. Вирус не может передаваться от свиней к человеку, между тем среди заразившихся животных смертность достигает 100%.