Преподобный Никон родился в Юрьеве-Польском. Ещё отроком он пришёл к преподобному Сергию, желая постричься в монахи. Сергий увидел чистоту и благоразумие юноши, но решил его испытать - он послал его к Афанасию Высоцкому, тот тоже не сразу принял Никона. Но когда увидел его искреннее желание - постриг отрока в иноческий чин.
Молодой человек преуспевал в добродетели, изучал Священное Писание и через некоторое время его рукоположили в сан священника. После этого Афанасий благословил его увидеться со святым Сергием. Сергий очень тепло принял Никона и тот стал его учеником. Он проводил дни в трудах, а ночи в молитвах. Сергий разъяснял ему сущность духовной жизни. За шесть месяцев до своего преставления он назначил Никона преемником. Никон с любовью поддерживал всё, что основал его духовный учитель. Он трудился наравне с братией. Но Никона тяготило звание настоятеля и он уединился в келье, а настоятелем стал преподобный Савва Сторожевский.
Когда в 1400 году Савва основал свой монастырь под Звенигородом, братия уговорили Никона снова стать их настоятелем, но каждый день он выделял себе время для безмолвия. В 1408 году на Русскую землю напал хан Едигей, инокам пришлось оставить обитель, а когда они вернулись, то увидели пепелище на месте монастыря. Никон не впал в уныние, он подвиг братию на новые труды. Прежде всего восстановили храм в честь Живоначальной Троицы, а постепенно восстановили и всю обитель.
Во время работ были обретены мощи преподобного Сергия - 5 июля 1422 года. Никон решил возвести каменную церковь и положить туда мощи своего духовного отца. Для украшения храма он пригласил лучших иконописцев - Андрея Рублева и Даниила Черного. Тогда преподобный Андрей и написал икону Живоначальной и Пресвятой Троицы.
Преподобный Никон до конца жизни заботился об устроении Троицкой церкви. Отошёл ко Господу преподобный 30 ноября 1426 года. Он погребен рядом с ракой преподобного Сергия Радонежского.