Ошибка была замечена при добавлении нового регистра сведений в расширение конфигурации на платформе 1с версии 8.3.22.2239, ошибка появляется при открытии формы регистра. Подозреваю что эта проблема может появляться и на других версиях платформы. Проблема скорее всего появляется когда в установленных расширениях нет ни одного добавленного справочника.
Решение:
Опытным путем выяснил что нужно просто создать в расширении (любом) справочник, после этого будет создана таблица в СУБД DataHistorySettingExt. После уже можно добавлять регистры итд.