Аниме выходило на экраны с 25 февраля 2006 года по 12 августа 2006 года в виде 23 эпизодов по 25 минут. Тайтлом занимались режиссёр Сюко Мурасэ, сценарист Дай Сато и студия Manglobe.
Сериал, на который сильно повлияли западная философия и гностицизм, а также содержит множество реминисценций и аллюзий на существующие произведения искусства; представляет собой комбинацию 2D-цифровой анимации, 3D-компьютерного моделирования и цифровых спецэффектов. После выхода в Японии аниме было лицензировано для выпуска на DVD компанией Geneon Entertainment с последующей телевизионной трансляцией на Fuse в Соединённых Штатах. Шоу также было распространено на австралийском, британском и канадском рынках аниме. С момента своего выпуска Ergo Proxy получил в основном положительные отзывы, которые высоко оценили его визуальные эффекты и темы.
12 июня 2015 года Министерство культуры Китая включило «Эрго Прокси» в список «38 наименований аниме и манги», запрещённых в Китае.
Манга «Эрго Прокси: Попутчики Се