Уважаемые коллеги, доброго времени суток! Представляем вам нидерландское научное издание Molecular Diversity. Журнал имеет третий квартиль, издаётся в Springer Netherlands, его SJR за 2022 г. равен 0,499, пятилетний импакт-фактор 3,3, электронный ISSN - 1573-501X, предметные области - Изыскание новых лекарственных веществ, Медицина (общие вопросы), Информационные системы, Неорганическая химия, Органическая химия, Физическая и теоретическая химия, Катализ, Молекулярная биология. Вот так выглядит обложка:
Здесь два редактора - Хонг-ю Ли, контактные данные - HLi2@uams.edu
и Кунал Рой - kunalroy_in@yahoo.com, kunal.roy@jadavpuruniversity.in.
Дополнительные публикационные контакты - bhuvaneswari.rangasamy@springernature.com, devi.selvaraj@springer.com, journalpermissions@springernature.com, ingrid.fischer@springer.com.
Журнал представляет новый публикационный форум для быстрой публикации рецензируемых статей, посвященных описанию разработки, применения и теории молекулярного разнообразия и комбинаторной химии в фундаментальных и прикладных исследованиях и разработке лекарств. К публикации принимаются как краткие, так и полные статьи, перспективы, новости и обзоры, касающиеся всех аспектов генерации молекулярного разнообразия, применения разнообразия для скрининга альтернативных мишеней всех типов (биологических, биофизических, технологических), анализа полученных результатов и их применения в различных научных дисциплинах/подходах, включая:
- комбинаторный химия и параллельный синтез;
- библиотеки малых молекул;
- микроволновый синтез;
- проточный синтез;
- фтористый синтез;
- синтез, ориентированный на разнообразие (DOS);
- нанореакторы;
- щелчковая химия;
- мультиплексные технологии;
- дизайн на основе фрагментов и лигандов;
- структура/функция/SAR;
- вычислительная химия и молекулярный дизайн;
- хемоинформатика;
- методы скрининга и интерфейсы скрининга;
- методы анализа и очистки;
- робототехника, автоматизация и миниатюризация;
- целевые библиотеки;
- библиотеки отображения;
- пептиды и пептоиды;
- белки;
- олигонуклеотиды;
- углеводы;
- природное разнообразие;
- новые методы о создании библиотек и деконволюции;
- направленной эволюции, происхождении жизни и рекомбинации;
- методах поиска, ландшафтах, случайной химии и многом другом.
Адрес издания - https://www.springer.com/journal/11030
Пример статьи, название - Identification of potential flavonoid compounds as antibacterial therapeutics against Klebsiella pneumoniae infection using structure-based virtual screening and molecular dynamics simulation. Заголовок (Abstract)
Klebsiella pneumoniae, which is among the top three pathogens on WHO's priority list, is one of the gram-negative bacteria that doctors and researchers around the world have fought for decades. Capsular polysaccharide (CPS) protein is extensively recognized as an important K. pneumoniae virulence factor. Thus, CPS has become the most characterized target for the discovery of novel drug candidates. The ineffectiveness of currently existing antibiotics urges the search for potent antimicrobial compounds. Flavonoids are a group of plant metabolites that have antibacterial potential and can enhance the present medications to elicit improved results against diverse diseases without adverse reactions. Henceforth, the present study aims to illustrate the inhibitory potential of flavonoids with varying pharmacological properties, targeting the CPS protein of K. pneumoniae by in silico approaches. The flavonoid compounds (n = 169) were retrieved from the PubChem database and screened using the structure-based virtual screening approach. Compounds with the highest binding score were estimated through their pharmacokinetic effects by ADMET descriptors. Finally, four potential inhibitors with PubChem CID: (4301534, 5213, 5481948, and 637080) were selected after molecular docking and drug-likeness analysis. All four lead compounds were employed for the MDS analysis of a 100 ns time period. Various studies were undertaken to assess the stability of the protein–ligand complexes. The binding free energy was computed using MM-PBSA, and the outcomes indicated that the molecules are having stable interactions with the binding site of the target protein. The results revealed that all four compounds can be employed as potential therapeutics against K. pneumoniae.
Graphical abstract
Keywords: Klebsiella pneumoniae; Capsular polysaccharide protein; Flavonoid; Drug; Virtual screening; Molecular docking; MD simulation