Такое летоисчисление было принято на I Вселенском Соборе в 4 веке в связи с рядом исторических событий.
Ещё в 1 веке до н.э. (до Рождества Христова) в летоисчислении Римской империи стал использоваться индиктион; исторически "индикт" (от лат. indictio - "объявление") - это был порядковый номер года внутри регулярно повторяющегося 15-летнего промежутка времени; один раз в 15 лет проводилась перепись населения. Установление индикта именно 1 сентября связывают с тем, что в 312 году святой равноапостольный император Константин Великий, когда ему было явлено изображение Креста на небе, одержал победу над узурпатором Максенцием. И уже в следующем году по Миланскому эдикту в Римской империи была провозглашена свобода вероисповедания, узаконены открытое исповедание христианской веры и официальная деятельность Православной Церкви (этот документ пресек гонения на христиан). Отцы I Вселенского Собора в 325 году в память об этом великом событии постановили начинать Новый год с 1 сентября - дня, ставшего началом "свободы христианской". За церковным праздником новолетия закрепилось название "индикт".
Есть указания на связь праздника начала Нового года с сентябрем-месяцем и на основе ветхозаветной истории, когда произошли важнейшие события. Например: начали убывать воды всемирного потопа и Ноев ковчег остановился на горах Араратских; святой пророк Моисей сошёл с горы Синай и принес людям скрижали, на которых был начертан Закон, данный Самим Господом; совершилось торжественное освящение великолепного храма Господня, созданного царём Соломоном, и в этот храм внесён Ковчег Завета со скрижалями.
Сам Господь Бог заповедал пророку Моисею, "месяца седьмого, когда вы собираете произведения земли, празднуйте праздник Господень" (седьмой месяц считается от марта - первого месяца от Сотворения мира).
С принятием Русью православного христианства Русская Церковь восприняла византийское летоисчисление по индиктам, а государственный год на Руси первоначально начинался с 1 марта - от Сотворения мира (ок.5508 г. до н.э.). В 1492 г. (который считался 7000 годом от Сотворения мира) гражданское и церковное новолетие были официальное объединены - с 1 сентября. А с 1700 г. по указу Петра I Новый год в государственном календаре стали отмечать с 1 января (по новому стилю эта дата приходится на 14 января и следует за Рождеством Христовым; известна нам как "старый Новый год"). Церковный же календарь сохранил традиции сентябрьского новолетия. А также по сей день мы отмечаем начало учебного года с 1 сентября, ведь истоки этого - в истории церковноприходских школ.
С первым днём сентября Священное Предание связывает и евангельскую историю, когда Господь Иисус Христос прочел в синагоге (собрании) Назарета пророчество Исаии о наступлении "лета Господня" (лето по-славянски означает год) - времени, когда "Бог посетит народ Свой", то есть в мир придёт давно ожидаемый Мессия. И в наши дни именно эта проповедь Спасителя вспоминается на Богослужении Нового года по православному календарю (1/14 сентября).
В сентябре начинается новый годовой богослужебный круг, и первый двунадесятый праздник в нём - Рождество Пресвятой Богородицы; это событие, предшествовавшее Боговоплощению - Рождеству Христову - и другим наиболее значимым церковным праздникам.
Тропарь индикта, глас 2
Всея́ тва́ри Соде́телю,/ времена́ и ле́та во Свое́й вла́сти положи́вый,/ благослови́ вене́ц ле́та бла́гости Твоея́, Го́споди,/ сохраня́я в ми́ре лю́ди и град Твой// моли́твами Богоро́дицы и спаси́ ны.
(Всего творения Создатель, времена и годы Своей властью определивший, благослови круг года благости Твоей, Господи, сохраняя в мире людей и город Твой по молитвам Богородицы и спаси нас.)
Кондак индикта, глас 2
В Вы́шних живы́й, Христе́ Царю́,/ всех ви́димых и неви́димых Тво́рче и Зижди́телю,/ И́же дни и но́щи, времена́ и ле́та сотвори́вый,/ благослови́ ны́не вене́ц ле́та,/ соблюди́ и сохрани́ в ми́ре град и лю́ди Твоя́,// Многоми́лостиве.
(Всевышний, Христос Царь Небесный, всего видимого и невидимого Творец и Создатель, дни и ночи, времена и годы сотворивший, благослови ныне круг года, сбереги и сохрани в мире город и людей Твоих, Многомилостивый!)