Алексей Иннокентьевич Антонов родился 9 сентября 1896 года в Гродно в семье офицера русской армии. Ему было 12 лет, когда умер отец, чуть позже умерла и мать. Алексей окончил 1-ю Петроградскую гимназию и в 1915 году поступил в университет, но он был вынужден прервать учебу и пойти работать на завод.
В 1916 году А.И. Антонова призывают в армию и направляют в Павловское военное училище. После окончания ускоренных курсов он получил чин прапорщика и был зачислен в егерский полк. В июле 1917 года участвовал в боях, получил ранение. За проявленную храбрость награжден орденом Святой Анны 4-й степени.
Новый этап в его жизни наступил в апреле 1919 года, когда он вступил в Красную Армию. В должности помощника начальника штаба 1-й Московской рабочей дивизии, а затем начальника штаба бригады 15-й Инзенской стрелковой дивизии Антонов участвует в боевых действиях на Южном и Кавказском фронтах. Важным событием в его жизни явился 1928 год, когда он поступает на учебу в Военную академию имени М. В. Ф