Ж. Алиев являлся владельцем трех учебных заведений: "Университет Астана", "Центрально-Азиатский университет" и "Казахстанский морской университет".
Тем не менее, Министерство образования и науки Республики Казахстан обнаружило серьезные нарушения государственных образовательных стандартов в работе этих университетов. Эти нарушения включали в себя недостаток необходимых учебных ресурсов и несоблюдение требований к минимальному числу студентов.
В ответ на выявленные нарушения, 19 декабря 2019 года руководство "Казахстанского морского университета" было привлечено к административной ответственности на основании решения Специализированной межрайонной административной судебной коллегии Мангистауской области за невыполнение предписания Министерства образования и науки по устранению выявленных нарушений законодательства. В результате этого руководству был наложен штраф в размере 15 МРП согласно статье 462 части 3 Кодекса об административных правонарушениях Республики Казахстан.
В дальнейшем эти учебные заведения были лишены лицензий на осуществление своей образовательной деятельности.