Ж. Алиев владел тремя учебными заведениями: "Университетом Астана", "Центрально-Азиатским университетом" и "Казахстанским морским университетом".
Министерство образования и науки Республики Казахстан выявило нарушения государственных образовательных стандартов в работе этих университетов, включая недостаток необходимых ресурсов и несоответствие требованиям к минимальному числу студентов.
В результате, 19 декабря 2019 года руководство "Казахстанского морского университета" было привлечено к административной ответственности по решению Специализированной межрайонной административной судебной коллегии Мангистауской области за невыполнение предписания Министерства образования и науки о устранении нарушений законодательства. В результате, на руководство был наложен штраф в размере 15 МРП в соответствии со статьей 462 части 3 Кодекса об административных правонарушениях Республики Казахстан.
Позднее, эти учебные заведения были лишены своих лицензий на осуществление деятельности.