В 1838 году по проекту академика архитектуры К.А. Тона началось строительство новой императорской резиденции - Большого Кремлевского дворца. Для его постройки разобрали стасовский дворец и все оставшиеся части дворца XVI-XVII веков, кроме Грановитой и Золотой Царицыной палат, Теремного дворца с дворцовыми церквями. Возведенный на высокой части Боровицкого холма Большой Кремлевский дворец занял доминирующее положение среди других дворцовых зданий.
Завершающим этапом реконструкции Кремля стало строительство на месте бывшего Конюшенного приказа нового здания Оружейной палаты, которое являлось частью императорского дворца. Позади Оружейной палаты, вплотную к Кремлевской стене было построено здание, в нижней части которого размещались императорские кареты и лошади.
Большой Кремлевский дворец был первым зданием в Кремле, до которого довели в начале 1850-х городской водопровод. По высочайшему указу 1856 года вода (7000-10000 ведер в сутки) отпускалась бесплатно. К водопроводу тогда был подключен и Вознесенский женский монастырь. Остальные брали воду из водоразборных фонтанов, ближайшие из которых располагались у дома Пашкова, на Воскресенской (Манежной) площади Зарядье.
В XIX веке политических событий общегосударственного масштаба в Москве происходило немного. В основном они связаны с пребыванием здесь императорской фамилии. После пуска в 1851 году Николаевской железной дороги, соединившей Петербург и Москву, посещение императором Первопрестольной перестало быть чем-то экстраординарным.
Родившийся в Кремле Александр II унаследовал престол в 1855 году, но не короновался до тех пор, пока не был заключен мир, завершивший проигранную, несмотря на героизм русских солдат и матросов, Крымскую войну 1853-1856 годов. На коронации военным были вручены медали с надписью "На тебя, Господи, уповахом и не постыдимся вовеки".
По случаю коронации 26 августа 1856 года император амнистировал осужденных за участие в восстании 14 декабря 1825 года.
Поражение в войне не только показало необходимость реформ, но и парализовало явное им сопротивление, которого боялся даже Николай I. Новы монарх нашел в себе достаточно сил, чтобы провести коренные преобразования в жизни страны. Отмена крепостного права не была изолированным правовым актом. Последовавшие за тем реформы суда, местного самоуправления, армии, как и множество менее заметных преобразований в области права и финансов, подготовленных и проведенных в течении двадцати пяти лет его царствования, открыли перед Россией возможности быстрого развития и пользовалось поддержкой основной части населения. Например, когда 17 апреля 1863 года был оглашен указ, значительно ограничивающий применение телесных наказаний , толпа народа собралась на Ивановской площади у Малого Николаевского дворца, чтобы выразить благодарность императору-москвичу у дома, где он родился.
В здании Сената в 1864 году начали работать организованные в соответствии с новыми законами Московский окружной суд и Московская судебная палата. Первое время заседания частенько отменялись "по причине отсутствия дел", но по мере развития судебной реформы Сенатская площадь стала одним из самых оживленных мест в Кремле.
