Одна из часто встречающихся рекомендаций по генетическому тестированию советует не кормить животное и ограничить общение с другими собаками за час до сбора буккального эпителия. За этой рекомендацией стоит, в общем-то разумное предположение, что если частицы пищи или биологический материал другой собаки попадут в тестируемый образец, это может так или иначе помешать проведению теста.
Поскольку эта рекомендация вызывает много вопросов у наших заказчиков, мы решили проверить это предположение и провели прямой эксперимент. Мы покормили двух собак, приведенных на фотографии, сыром, сушеным говяжьим мясом, сушеным бараньим мясом и сосиской из магазина - лакомствами, которые часто используют на выставках. Каждой собаке досталось примерно 20г. сыра, половина сосиски, одна говяжья палочка и примерно 15 г. баранины. Буккальный эпителий собрали сразу после еды, а также через 5, 10 и 60 минут.
На следующий день с собаками играли при помощи пуллера - они по очереди приносили игрушку. Игра продолжалась до тех пор, пока не стало абсолютно ясно, что по-крайней мере слюной они точно обменялись (кто имел дело с пуллером, знает, как это понять!). Сразу после игры у обеих собак также собрали соскобы буккального эпителия.
Ранее мы протестировали обеих собак и одна из них оказалась гомозиготной по мутации FGF5:c.284G>T (L1), связанной с длинношерстностью, а вторая - не несет этой мутации. Соответственно, как видно на фото, одна собака длинношерстная, а другая - короткошерстная.
Мы провели тестирование собранных образов нашей тест-системой на длину шерсти, чтобы проверить, повлияет ли кормежка и совместная игра на результат теста? На диаграмме приведены результаты для всех собранных образцов. Все результаты длинношерстной собаки расположились вдоль вертикальной оси, как и стандартный образец, соответствующий результату L/L. Все образцы короткошерстной собаки расположены вдоль горизонтальной оси, что полностью соответствует генотипу S/S.
Таким образом, в этом эксперименте кормежка и игра с собакой никак не отразилась на точности теста. Это означает, что эта рекомендация является в значительной степени избыточной. Разумеется, следует избегать загрязнения образцов чем-либо, но, судя по всему, при соблюдении элементарной аккуратности прикормка во время выставки и даже достаточно интенсивное общение с другими животными не оказывает влияния на результат. Так показал эксперимент!
