Найти в Дзене
Nick Krayst

Хранение, запрос, передача, просмотр и обработка медицинских данных и исследований в формате DICOM часть 2я.

Продолжим разговор о DICOM, ГОСТ Р ИСО 12052-2009 Информатизация здоровья. Цифровые изображения и связь в медицине (DICOM), включая управление документооборотом и данными. На сайте https://www.dicomstandard.org/current вы можете скачать описание действующего международного стандарта DICOM на английском языке.

Абстрактный вид Радиологической Информационной Системы
Абстрактный вид Радиологической Информационной Системы

Рассматривая общий абстрактный вид Радиологической Информационной Системы (РИС) мы видим, рабочие места лаборантов и врачей с оборудованием объединённых в компьютерную сеть, но как она работает и из чего состоит мы разберем ниже.

телекоммуникационный шкаф РИС
телекоммуникационный шкаф РИС

Телекоммуникационный шкаф РИС это сердце всей системы, он состоит из управляемого коммутатора иногда маршрутизатора, ИБП, системы охлаждения шкафа, ящика документации, подсветки, серверных платформ и СХД-массивов. Как правило выбирается телекоммуникационный шкаф высотой не менее 24U в зависимости от объемов исследований и количества рабочих мест и аппаратуры. Исследования которые не обходимо хранить 2 (норма), 5(взрослая патология), 10 лет (детские), а не которые как онко и более, что регламентируют документы МинЗдрава России.

Серверная платформа приложений для 19" стойки
Серверная платформа приложений для 19" стойки

Серверные платформы приложений строят на базе Linux или Windows операционных систем решающие задачи доступа к системам управления баз данных на скриптовом языке SQL, веб интерфейсу сайта РИС, DICOM-файловому массиву на СХД построенных по технологии RAID10 c использованием JBOD технологии на базе SAS-интерфейсов для SATA дисков для снижения стоимости внедрения, но не владения, так как существенную стоимость вносят носители информации - жесткие диски технологически ограниченные в скорости обмена и доступности данных во времени, информационном объёме хранения и времени эксплуатации.

Но сейчас мы затронем только часть РИС в части PACS-системы собственно DICOM-файловую часть:

Абстракция о dcm-файле и его перемещение
Абстракция о dcm-файле и его перемещение

На немецком сайте https://dicom.offis.de/en/dcmtk/dcmtk-tools/ вы можете скачать бесплатный набор инструментов работы с DICOM и в том числе исходники их, что редко делают наши российские разработчики в очередной раз изобретая велосипед.

Начнем с модальности в DICOM (тэг данных 0008,0060), которая определяет о чем данные, а не исследований и оборудования с которым будет взаимодействие, как пишут многие около DICOM-товарищи в интернете.

Стандартом зафиксированы следующие обозначения модальностей:

Типы (модальности) поддерживаемых стандартом DICOM медицинских изображений представлены ниже:

EPS — Электрофизиология сердца (Cardiac Electrophysiology);

CR — Компьютерная рентгенография (Computed Radiography);

CT — Компьютерная томография (Computed Tomography);

DX — Цифровая рентгенография (Digital Radiography);

ECG — Электрокардиография (Electrocardiography);

ES — Эндоскопия (Endoscopy);

XC — Наружная фотография (External-camera Photography);

GM — Микроскопия общего назначения (General Microscopy);

HD — Кривые кровотока (Hemodynamic Waveform);

IO — Рентгенография ротовой полости (Intra-oral Radiography);

IVUS — Внутрисосудистый ультразвук (Intravascular Ultrasound);

MR — Магнитно-резонансная томография (Magnetic Resonance);

MG — Маммография (Mammography);

MS — Микроскопия (Microscopy);

NM — Ядерная медицина (Nuclear Medicine);

OP — Офтальмологическая фотография (Ophthalmic Photography);

PX — Панорамная рентгенография (Panoramic X-Ray);

PT — Позитронно-эмиссионная томография (Positron emission tomography);

RF — Рентгенофлюороскопия (Radiofluoroscopy);

SM — Слайд-микроскопия (Slide Microscopy);

US — Ультразвуковая диагностика (Ultrasound);

XA — Рентгеновская ангиография (X-Ray Angiography);

BI — Биомагнитные изображения (Biomagnetic imaging);

CD — Цветовое доплеровское картирование (Color flow Doppler);

DD — Двойное допплеровское картирование (Duplex Doppler);

DG — Диафанография (Diaphanography);

LS — Поверхностное лазерное сканирование (Laser surface scan);

ST — Однофотонная эмиссионная компьютерная томография (Single-photon emission computed tomography (SPECT));

TG — Термография (Thermography);

HC — Твердая копия (Hard Copy);

AU — Аудиозаписи (Audio);

SR — Документ структурированного отчёта (SR Document);

SMR — Стереометрическое взаимодействие (Stereometric Relationship);

OT — Другое (Other).

модальности меняются одни устаревают другие появляются DICOM пока как живой организм.

Весь поток данных в РИС начинается с назначения врачом исследования хранящегося в базе данных программы DICOM WorkList тэги которого определяются UID SOP class-ом с значением "1.2.840.10008.5.1.4.31" для запроса выборки своих назначений рабочим местом которому назначено.

Набор тэгов DICOM WorkList C-FIND UID SOP Class 1.2.840.10008.5.1.4.31, 
которых придерживается компания Philips Healthcare.
Набор тэгов DICOM WorkList C-FIND UID SOP Class 1.2.840.10008.5.1.4.31, которых придерживается компания Philips Healthcare.

В выше приведенной таблице мы видим колонку VR в которой присутствуют обозначения типа данных тэга:

CS - текст до 64 знаков

PN - ФИО до 64 знаков

AE - Входное имя программы до 16 знаков

UI - UID-унификатор

SQ - UID SOP class

TM - время

DA - дата

Об остальных типах вы узнаете в описании стандарта DICOM по ссылкам выше.

Для создания своего dcm-файла мы можем воспользоваться DICOM Tools Kit с немецкого сайта ссылка выше.

Используя приложение dcm2img.exe для визуального представления например jpg-файла или с помощью dcm2sr.exe протокол описания в pdf-файле, указав в xml-файле соответственно необходимые тэги DICOM согласно UID SOP class-у.

Тем самым можно сделать собственные рабочие места под свои нужды.

Более подробную информацию читайте в следующих статьях.