Генерал Лопырев был арестован в конце осени 2016 года и приговорен в ноябре 2017 года к десяти годам лишения свободы и штрафу в 150 миллионов рублей за получение взятки на сумму около 6,3 миллиона рублей и незаконное хранение сотни патронов. При этом его не лишили звания генерал-лейтенанта и государственных наград.
Задержание Лопырева произошло в связи с подозрением в получении взяток от гендиректоров строительных компаний и посредников в связи с ремонтом инженерных коммуникаций резиденции президента России в Сочи «Бочаров Ручей». В ходе обыска у него были обнаружены порядка 100 патронов от пистолета.
Приговором суда его наказание было сокращено до девяти лет и восьми месяцев лишения свободы, а штраф – до 130 млн рублей. Однако, в больнице Лопырев скончался после того, как пожаловался на плохое самочувствие.