Центр парасимпатической нервной системы находится в головном мозге в парасимпатических ядрах III , VII , IX и X черепных нервов и спинном мозге в сегментах S2-S5. Около 75% всех парасимпатических нервных волокон расположены в X черепном нерве или в блуждающем нерве. Поэтому, когда мы говорим о парасимпатической системе, мы имеем в виду этот нерв (или нервы, потому что их два).
Блуждающий нерв иннервирует органы шеи, груди (сердце, легкие), затем желудок, пищевод, желчный пузырь, поджелудочную железу, тонкий кишечник и толстая кишка к левой кривой. Парасимпатические волокна III черепного нерва (нерв, управляющий глазным яблоком иннервируют радужную оболочку и цилиарное тело глаза. Волокна VII и IX иннервируют слезные и железа Волокна спинного мозга, идущие от крестцового центра, иннервируют заднюю часть толстой и прямой кишки, мочевой пузырь и половые органы.
Как и симпатическая нервная система, эта система состоит из пре- и постганглионарных волокон. Однако здесь ганглии расположены в стенке органа-мишени, поэтому преганглионарные волокна длинные, а постганглионарные волокна очень короткие, всего несколько миллиметров.
Нейромедиатор ацетилхолин высвобождается на преганглионарных парасимпатических волокнах, и этот нейромедиатор (ацетилхолин), также высвобождается на постганглионарных волокнах. Он связывается с рецепторами ацетилхолина. Для этого нейромедиатора существуют никотиновые и мускариновые рецепторы.