Для автономных судов установлен порядок ведения судового журнала. Он опубликован на Федеральном портале для размещения проектов нормативно-правовых актов опубликован Порядок ведения судового журнала владельцем полностью автономного судна в электронном виде.
Судовой журнал полностью автономного судна должен вестись в электронном виде владельцем полностью автономного судна, имеющего право плавания под государственным флагом Российской Федерации, в течение всего периода эксплуатации этого судна.
Судовой журнал подлежит учету капитаном бассейна внутренних водных путей или капитаном морского порта в реестре регистрации журналов, который ведется в форме электронного документа.