Но этого было мало...
В 1589 году в период правления Бориса Годунова состоялось наречение митрополита Иова патриархом Московским и всея Руси.
Ну конечно все было не просто, для начала надо было обо всем договориться, для этого в 1586 г. Москву посетил Антиохийский патриарх Иоаким, а в 1588 г. — Константинопольский патриарх Иеремия II, которые согласились с идеей учреждения Московского патриаршего престола.
Кстати претендентов было трое, кроме митрополита Московского и всея Руси Иова можно было выбрать или архиепископа Новгородского Александра или архиепископа Ростовского Варлаама, но история выбрала Иова.
На всякий случай на следующих Константинопольских Соборах 1590 и 1593 гг. всем напоминали о правах русского патриарха и пределах его юрисдикции "он будет иметь патриаршее достоинство и честь, и сочетается и мерится с прочими Патриархи на вся веки...".
В 1721 г. в царствование Петра I патриаршество было упразднено; императором была учреждена Духовная коллегия, потом правда ее переименовали в Святейший правительствующий Синод — государственный орган высшей церковной власти. ( не хотел Петр власть делить).
28 октября (11 ноября) 1917 г. решением Всероссийского поместного Собора патриаршество было восстановлено. Вот именно! Вразгар революции, Поместный собор Российской православной церкви принял постановление о восстановлении патриаршества, отменённого в 1721 г. в связи с переходом на синодальную систему управления Русской православной церковью.
И снова три кандидата ( кстати снова один из претендентов Новгородский) (митрополиты Харьковский Антоний, Новгородский Арсений и Московский Тихон. Новым руководителем церкви стал председатель Собора митрополит Московский Тихон.
Но снова не случилась дружба 19 января (1 февраля) 1918 г. патриарх объявляет анафему безбожной власти. А власть отвечает Декретом «Об отделении церкви от государства, а школы от церкви», лишивший церковь всего её имущества и ограничивший её влияние на все сферы общественной жизни. Патриарха Тихона помещают под домашний арест, заводят дело, патриарх написал заявление о раскаянии в «антисоветских поступках», дело закрывают. В апреле 1925 г., патриарх Московский и всея Руси Тихон скончался в возрасте 60 лет.
Следующий патриарх церкви будет избран только во время Великой Отечественной войны, 8 сентября 1943 г.