Л.Н. Толстой не мог быть похоронен на православном кладбище, так как при жизни был отвратителен церкви.
Могила писателя находится на поляне в лесу. Именно там он любил бывать в последние годы жизни. Однако во время Великой Отечественной войны прах Толстого был потревожен.
Сычокинский район Тульской области, где находится Ясная Поляна, был оккупирован немцами 28 октября 1941 года. На следующий день захватчики появились на территории музея Л.Н. Толстого. Внучка писателя, Софья Андреевна Толстая-Есенина, которая несколько месяцев была директором, к тому времени уже вывезла основные экспонаты и рукописи. Всего было вывезено 110 ящиков с имуществом Толстого.
Однако здание и оставшиеся в нем предметы оказались в полном распоряжении нацистов 1 ноября.
Командующий 2-й танковой группой полковник Гейнц Гудериан лично посетил Ясную Поляну.
Фашисты построили на территории музея госпиталь для раненых солдат и офицеров, а позже - солдатские казармы и офицерские квартиры.
Комнату, в которой был создан роман "Война и мир", солдаты вермахта превратили в курительную комнату.
Оккупация закончилась через 47 дней. По словам биографа Софьи Толстой-Есениной Любови Подосвиловой, когда 15 декабря 1941 года сотрудники вернулись в Ясную Поляну, их взору предстало "страшное" зрелище:
В сгоревшем доме были пустые окна, в библиотеке и спальне писателя - прогоревшие полы. Печальное зрелище представлял собой и двор музея, превращенный в скотобойню. На деревьях и заборах висели туши свиней и коров. Но еще более шокирующее зрелище ожидало сотрудников музея в лесу. Вокруг могилы Толстого стояли 76 березовых крестов, исписанных немецкими словами и свастикой.
По другим данным, вражеских захоронений было еще больше. Старший политрук Павел Трояновский сообщал в "Красную звезду", что "рядом с прахом Толстого фашисты похоронили 300 паршивых солдат".
Таким образом, могила Толстого неожиданно оказалась посреди немецкого военного кладбища. Однако, как утверждает в своих мемуарах Гудериан, сама могила писателя осталась нетронутой.
«Я сам посетил могилу Толстого и нашел ее в хорошем состоянии. Ни один солдат к ней не прикасался», - писал немецкий генерал.
Хорошо сохранившееся состояние могилы подтверждается фотографиями, сделанными в то время.
Немцы выбрали крайне неудобное с практической точки зрения место для кладбища. Во-первых, могила Толстого находится менее чем в километре от усадьбы. Обычно немцы хоронили солдат возле больницы. Во-вторых, под землей запуталось множество корней деревьев, что затрудняло рытье могилы. Впрочем, самим нацистам не пришлось утруждаться.
Как вспоминает режиссер Сергей Щегорев, местные крестьяне копали могилы под угрозой немецких штыков.
Комиссия Академии наук, расследовавшая последствия оккупации Ясной Поляны, пришла к выводу, что кладбище было "устроено с явной целью осквернить память великого писателя, культурно-историческую святыню для народов Советского Союза и всего мыслящего человечества".
События в Ясной Поляне нашли отражение в докладной записке министра иностранных дел Вячеслава Молотова от 6 января 1942 года: "... . славный памятник русской культуры, выбитый 14 декабря частями Красной Армии из-под ног захватчиков, был разрушен, изуродован и, наконец, подожжен фашистскими вандалами".
Для советских властей восстановление объекта наследия было вопросом международного престижа. Толстовский дом был отреставрирован и открыт для посетителей весной 1942 года.
Немецкое кладбище было ликвидировано еще раньше, в январе 1942 года. 83 тела, эксгумированные с кладбища, были захоронены в яме, оставшейся после взрыва. 20 мая 1942 года сотрудники музея расчистили открытую площадку рядом с могилой.