Начало ему положила Варвара Морозова - русская предпринимательница и меценат. Из семье тех самых знаменитых Морозовых. Варвара Алексеевна выстроила психиатрическую клинику и подарила городу участок для неврологической клиники. В 1897 г. клинический городок был полностью построен и оснащен. В составе: психиатрическая, акушерская, гинекологическая, терапевтическая, хирургическая, детская, патологоанатомическая, дерматологическая клиники. Медицинские институты с факультетами всех направленностей.
В общей сложности 13 клиник и 12 институтов. В 1899 году на территории клинического городка открылось общежитие для студентов медицинского факультета. Как известно, М. Булгаков был врачом и в 1921 году он с женой Татьяной жил здесь по приезду в Москву. В 1903 по инициативе Л. Л. Левшина в составе университетского клинического городка была создана первая в России лечебница-приют для больных раком. В 1930 году медицинский факультет МГУ получил имя И. М. Сеченова и был размещен в зданиях Клин