В 1930-е годы на Королёва едва не убили.
Он был задержан по подозрению в контрреволюционной деятельности, допрошен и, предположительно, подвергнут пыткам. Приговор был смягчен, а затем пересмотрен "за отсутствием состава преступления". С другой стороны, Сергей Павлович ранее прошел через восемь лет трудовых лагерей, пересыльную тюрьму и другие ужасы, обычные для политических заключенных.