В конце ледникового периода из-за значительного подъема уровня моря образовалось Японское море. Считается, что на отрезанном от континента Японском архипелаге собак еще не было. Спустя годы, в период Дзёмон, на японском архипелаге появились «собаки Дзёмон». Конечно, они не произошли от японских волков, а прибыли с народом Дзёмон. У собаки Дзёмон было тело, похожее на тело сиба-ину, стоячие уши и хвост, худощавое телосложение с неглубоким лбом. В скелетах собак Дзёмон, раскопанных по всей стране, нет серьезных различий. Из-за повторного инбридинга (скрещивание близкородственных форм в пределах одной популяции) в пределах архипелага вид характеризуется карликовостью. В период яёй в западную Японию начали проникать собаки яёи, пришедшие с Корейского полуострова. Скрестившись с собаками Дзёмон, собаки-яёи достигли восточной Японии и распространили свое влияние на весь Японский архипелаг, поглотив северных собак охотской культуры. Собаки дзёмон и собаки яёй скрещивались, образуя уникальные