Одной из главных достопримечательностей Каракола является Свято-Троицкая православная церковь, построенная в XIX веке русской общиной города.
История церкви началась с момента основания города Каракол в 1869 году, когда первые русские переселенцы выстроили на этом месте небольшую церковь. Однако простояла она относительно недолго и была разрушена землетрясением в 1876 году. Постройка же новой церкви была начата в 1895 году архитекторами из города Верный (нынешняя Алма-Ата), которые и спроектировали это здание в том виде, в котором оно стоит и сейчас. Крышу церкви венчают 5 куполов, а стены сложены из деревянных бревен, которые украшены резьбой и различными росписями.
Судьба у церкви в советский период была довольно тяжелая. После Октябрьской революции, в рамках советской кампании по борьбе с религией, церковь была закрыта, а позднее переоборудована в детскую спортивную школу.
С незначительными перерывами, школа функционирует в этом здании вплоть до 1986 года, когда было принято решение реконструировать церковь и сделать на ее основе краеведческий музей. Работы по восстановлению церкви длились 3 года, однако из-за распада СССР музей так и не был создан, а отреставрированное здание в 1992 году заняли священнослужители.
Одной из главных православных достопримечательностей церкви является икона Тихвинской Божией Матери, которая была написана в 1897 году.
Свято-Троицкая церковь Каракола свободно открыта для посещения туристам, однако женщинам рекомендуется при входе покрывать голову платком, который можно взять на входе.
