Крупный учёный в области физиологии, эндокринологии и биологии развития. Он является автором более 200 работ в области эндокринологии и биологии развития и более 20 научно-популярных книг и брошюр по биологии. По совокупности научных трудов, без защиты ему были присвоены ученые степени доктора биологических и доктора сельскохозяйственных наук. В 1935 г. он стал действительным членом Всесоюзной академии сельскохозяйственных наук (ВАСХНИЛ).
Завадовский участвовал в работе V международного генетического конгресса в Берлине (1927 г.); XIII, XIV и XV международных конгрессов физиологов в Бостоне (1929 г.), в Риме (1932 г.), в Ленинграде и Москве (1935 г.), Международного конгресса по истории науки и техники в Лондоне (1930 г.), Международного конгресса свободомыслящих в Праге (1936 г.). Являлся членом-корреспондентом Академии естественных наук в г. Галле (Германия, с 1932 г.), Национального географического общества США (с 1935 г.), Лондонского зоологического общества (с 1940 г.).
Биологический музей имени К. А. Тимирязева — любимое детище Бориса Михайловича Завадовского. Он был его основателем и директором более четверти века (с 1920 по 1949 год).
Подготовительные работы по созданию музея начались с осени 1920 года, когда Б. М. Завадовский стал заведующим кафедрой биологии Коммунистического университета имени Я. М. Свердлова. Решение об учреждении музея было принято на президиуме совета университета 24 апреля, а официальное открытие состоялось 7 мая 1922 года. Музей был назван именем К. А. Тимирязева, которого Завадовский считал своим учителем.
В основу собрания экспонатов для нового музея были включены коллекции Кружка по изучению флоры и фауны университета Шанявского, коллекция зоологических и анатомических препаратов профессора Д. Ф. Синицына, а так же «Музей живой природы», созданный доцентом А.Л. Бродским еще на научно-популярном отделении Университета Шанявского.
Б. М. Завадовским с сотрудниками были заложены основные принципы нового музея, отличающие его от других:
- это не «вещевой», а проблемный музей, раскрывающий основные обобщающие проблемы биологии, объединенные эволюционной идеей;
- это музей — лекторий, помогающий в получении биологических знаний и ориентированный в первую очередь на учащуюся молодежь;
- это музей — лаборатория, дающий практические навыки в проведении экспериментальных исследований;
- это «живой» музей, направленный на изучение жизнедеятельности организмов и потому широко использующий показ живых растений и животных.
В Биологическом музее впервые в музейной практике получили экспозиционное воплощение многие направления биологии, нигде ранее не показывавшиеся:
- экология,
- генетика,
- физиология растений,
- эндокринология и физиология человека и животных,
- ряд разделов теории эволюции.
