В этой статье обсуждаем ДНК-профиль (синонимы: генетический паспорт, DNA профиль). У заводчиков возникают вопросы совершенно практического характера, касающиеся процедуры сдачи материала на этот тест, в частности, кто и как идентифицирует животное. Разберемся во всем по порядку.
Что такое генетический паспорт?
Генетический паспорт - это результат специфического генетического теста. Этот тест выявляет особенности в ДНК конкретной собаки, отличающие ее от всех остальных.
У собак обнаружены участки ДНК, в которых отличия встречаются существенно чаще, чем в остальных. Большое разнообразие вариантов ДНК в таких участках позволяет использовать их для того, чтобы отличать одну собаку от другой. Очевидно, что чем больше таких участков будет охарактеризовано в результате исследования, тем более индивидуальным получится ДНК профиль. Различия в таких участках не связаны с какими-либо заболеваниями.
В настоящее время в нашей лаборатории для собак используется метод, одобренный ISAG, который анализирует 22 участка ДНК, что позволяет получать неповторимые индивидуальные ДНК профили для каждой собаки (https://vetgenomics.ru/parentage).
Такой же принцип используется при составлении генетических паспортов для кошек, коров, слонов, тигров, а также многих других животных и человека.
Что записано в генетическом паспорте?
При проведении анализа определяются длины участков ДНК в каждом из 22 районов. В этих районах находятся так называемые короткие тандемные повторы - участки ДНК, в которых повторяется короткая последовательность из 2-6 букв ДНК (как устроена ДНК описано здесь: https://www.facebook.com/groups/vetgenomics/permalink/493475567960926/). Число таких повторов в каждом участке может варьироваться, и современные методы анализа позволяют с высокой точностью детектировать эти отличия. Определение длин повторенных участков и лежит в основе составления генетического паспорта.
Следует помнить, что ДНК в организме представлена двумя копиями, от отца и от матери. Соответственно, каждый из 22 вариабельных участков представлен двумя вариантами. Эта информация также учитывается в генетическом паспорте, например:
AHT121: 94/110.
Эта запись означает, что у исследуемой собаки участок на 13 хромосоме, называемый AHT121, который содержит повторенную последовательность ДНК (CA)n, представлен двумя вариантами, один длиной 94, а другой - 110.
Продолжение о том, как использовать генетический паспорт и как происходит идентификация животного при выдаче генетического паспорта мы расскажем во второй части статьи.