Многотысячные гнездовые колонии на островах Торейских озер - одна из главных достопримечательностей заповедника. Они очень похожи на широко известные птичьи базары на морских островах - шум, гам, толчея, как на многолюдном рынке. На Торейских озерах птицы строят гнезда прямо на земле среди каменных валунов и на песчаных пляжах. Здесь гнездятся большие бакланы, серые цапли, монгольские чайки, реликтовые чайки, чегравы, чайконосые и речные крачки. Из них первые три вида составляют основу поселений. Птицы предпочитают селиться на мелких и средних по размеру островах, поскольку на крупных могут быть хищники, например, лисы или енотовидные собаки. Колонии пернатых очень плотные, например, гнезда бакланов нередко расположены настолько близко друг к другу, что между ними невозможно пройти. Это помогает птицам совместно защищать потомство от хищников. Непрошенных гостей наиболее активно атакуют монгольские чайки, чегравы и крачки. В многоводные годы на Барун-Торее существует 11 островов, самые крупные смешанные колонии расположены на четырех из них (Хухан, Каменный, Бакланий, Чаячий). Хухан имеет особое значение – только здесь в России гнездится реликтовая чайка. На оз. Зун-Торей при высоком уровне воды имеется только один безымянный остров. Колонии на нем обычно отсутствуют, поскольку остров имеет крупные размеры.
При значительном падении уровня воды в озерах условия обитания для птиц ухудшаются и «птичьи базары» постепенно исчезают. Торейские озера стремительно усыхают начиная с 2000 г. В 2002 г. птицы неожиданно основали небольшую колонию на острове Зун-Торея, которая в последующие годы начала стремительно расти. Оказалось, что сюда начали переселяться пернатые с других частей даурского региона, где из-за засухи уже невозможно было гнездиться. На Торейских озерах в это время условия обитания оставались благоприятными. Затем на Зун-Торей начали переселяться птицы и с островов Барун-Торея. Он намного мелководнее, чем Зун и потому быстрее высыхает. Значительное падение уровня воды в Барун-Торее и увеличение ее солености вызвали в 2004-2006 гг. массовые заморы рыбы, составляющей основу питания бакланов, цапель, монгольских чаек и многих других колониальных видов птиц. В 2008 г. птицы на Барун-Торее уже почти не гнездились, а в 2009 г. он высох полностью. На острове Зун-Торея поселения птиц достигли пика к 2007 г. Особенно потрудились бакланы – они возвели здесь целый город. Мы насчитали 2415 их гнезд. Прочные, сделаны из веток и толстых стеблей и по форме напоминают башни около полуметра в диаметре. Они стояли плотными рядами, как дома в городе. В центральных «кварталах» возвышались высотные здания – многолетние гнезда, которые бакланы ежегодно достраивают. В «пригороде» - строения пониже. Это более молодые гнезда. По высоте построек отчетливо было видно, как зародилась колония и как она росла и ширилась. Первые гнезда были построены на вершине бугра. Остальные год за годом пристраивались по периферии. С 2008 г. колония на Зун-Торее также начала уменьшаться. Теперь уже и в этом озере рыбы не хватало для прокорма потомства. Бакланы были вынуждены летать на рыбалку за 65 км (!) в Монголию на оз. Хух-Нур. А в 2009 г. остров превратился в полуостров, соединившись с берегом. В этот год уже никому не удалось вырастить птенцов. Гнездование стало бессмысленным, поскольку лисы и другие наземные хищники получили свободный доступ к колонии. Тем не менее, даже в 2010 г. несколько сотен пар бакланов предприняли безуспешную попытку гнездования. С 2011 г. колония пуста. Но минует еще несколько лет и придут дожди, и вернется вода. И опять на Торейских озерах закипит жизнь «птичьих базаров». А пока птицы создают временные поселения на других озерах и реках, где сохранилась вода и рыба. Таков сложившийся тысячелетиями ритм жизни Даурии.