Главной достопримечательностью Даурского заповедника являются окруженные степями Торейские озера. Озеро Барун-Торей (в переводе с бурят-монгольского - западное озеро) и Зун-Торей (восточное озеро) – крупнейшие водоемы Забайкальского края, можно считать остатками древнего моря, существовавшего здесь в период от 150 до 80 млн. лет назад. Свидетельством тому являются довольно часто встречающиеся на побережье обломки доисторических кораллов.
Озера имеют непостоянный водный режим, колебания их уровня обусловлены в значительной мере циклическими изменениями климата: за последние 200-220 лет озера неоднократно высыхали и наполнялись с периодичностью около 30 лет. При максимальном наполнении площадь Барун-Торея составляет 550 км2, Зун-Торея – 285 км2. Во время максимального наполнения эти водоемы обильны рыбой, преимущественно серебряным карасем. Торейские озера являются частью бессточного бассейна, принимающего воду из рек Ульдза и Ималка. Последняя в засушливые периоды может полностью пересыхать, Ульдза же в такие периоды часто не дотекает до устья, также частично пересыхая. Между собой озера связаны протокой Уточи. Наличие в воде гидрокарбонатных солей, взвеси и ила придает воде Тореев необычный молочно-белый цвет.
Северо-восточное побережье озера Зун-Торей окаймляет гряда сопок вулканического происхождения (поэтому здесь нередки находки вулканического туфа, друз горного хрусталя, различных халцедонов). Есть и находки орудий труда древнего человека; скребки и ножи, выполненные из халцедона, встречаются чаще других.
Торейские озера - это настоящее царство птиц. Здесь обитает более 300 видов пернатых, из которых около 40 видов занесены в Красную книгу России, а около 20 – в Красный список глобально угрожаемых видов Международного Союза охраны природы. Только здесь в России гнездится реликтовая чайка, только здесь можно встретить тысячные стаи гусей-сухоносов, а также 6 видов журавлей одновременно (в том числе все пять видов, внесенных в Красную книгу РФ).
Торейские озера и их окрестности - одно из важнейших в Азии мест концентрации перелетных птиц. Водоемы расположены на пересечении Центральноазиатско-Индийского пролетного пути и внутриконтинентальной ветви Восточноазиатско-Австралийского пути пролета птиц. Во время миграции в котловине Торейских озер останавливаются на отдых и кормежку миллионы птиц.
Для млекопитающих эта территория также имеет важное значение: именно в ближайших окрестностях Торейских озер сформировалась единственная на сегодняшний день в России оседлая размножающаяся группировка монгольского дзерена численностью около 3500 особей.
В 1994 году Торейские озера включены в Список водно-болотных угодий международного значения (Рамсарская конвенция) как местообитание околоводных и водоплавающих птиц.