Для дальнейшего развития сюжета вселенной имеют значения три особенных персонажа: бывший военный, а ныне рок-звезда Джонни Сильверхенд, и его подружки - Бестия и Альт. Именно Альт здесь играет особую роль, так как эта девушка является автором программы "Душегуб", которая позволяет переносить сознание человека из тела в тело.
Корпорация "Арасака" узнает об изобретении Альт. Бойцы компании похищают девушку и заставляют ее написать копию "Душегуба", которая позволила бы Сабуро Арасака осуществить свою давнюю мечту и жить вечно.
Альт не остается выбора, кроме как подчиниться, но хакерша понимала, что, стоит ей закончить работу, как с ней будет покончено. Потому она оставляет в программе несколько лазеек, которые позволят ей манипулировать своими пленителями и использовать софт по собственному усмотрению.
Как Альт и полагала, "Арасака" решила избавиться от нее, опробовав на ней же новую версию "Душегуба". Тело девушки погружается в кому, будучи подключенным к компьютеру, в котором теперь содержалась оцифрованная личность хакера.
Однако все идет не так, как Сабуро рассчитывал. Проникнув в сеть, Альт берет ее под собственный контроль. Ряд технических специалистов "Арасаки", подключенные к сети, погибают от "поджаренных" мозгов, а сама Альт пытается вернуться в свое тело. В этот момент на базу "Арасаки" проникает Джонни Сильверхенд со своей бандой рокеров, намереваясь спасти возлюбленную.
К сожалению, именно вмешательство Джонни нарушает планы Альт. Отключив тело девушки от компьютера, парень, тем самым, отрезает ей возможность вернуться обратно. Посчитав любимую мертвой, Джонни покидает здание, не осознавая, что копия сознания Альт остается бродить по цифровой вселенной, используя в качестве базы сервера "Арасаки".
С того момента проходит 10 лет. За это время война между корпорациями перешла на следующий этап, задействовав в этом противостоянии не только свои частные армии, но и наемников. Среди оных и оказывается Джонни Сильверхенд со своей подругой Бестией, с которыми в один момент связывается цифровая версия Альт.
Девушка сообщает, что все это время она жила на базе "Арасаки", но теперь она просит Джонни не совершать никаких необдуманных поступков. Альт сама говорит, что Джонни должен сделать - проникнуть на базу корпорации и заложить на ней ядерную бомбу, взрыв которой позволит заложнице сбежать с серверов компании.
Начав штурм башни, в которой располагался головной офис "Арасаки", Джонни с товарищами делает так, как Альт ему сказала. Но в процессе план нарушается вмешательством Адама Смешера - особого бойца-киборга, который убивает наемников и делает так, что бомба взрывается преждевременно. В ядерном пламени уничтожается не только база с серверами, но и огромное число простых людей, которые к этому конфликту не имели никакого отношения.
В то же время, Альт все-таки удается сбежать из плена "Арасаки", тогда как раненный Джонни вместо нее оказывается в заложниках у корпоративных головорезов. Бестии удается спастись, а ее дружка оцифровывают "Душегубом", отправив копию сознания рокера в виртуальную тюрьму. Так "Арасака" поступает довольно часто, ведь в эпоху технологий разум пытать куда проще, чем калечить тело.
Как бы там ни было, корпорации удалось оклематься от взрыва и отстроить свой небоскреб заново. Под ним теперь располагалось хранилище с цифровыми копиями людей "Микоши", которые представляли какую-либо ценность для корпорации.
Разработку Альт специалисты "Арасаки" доработали. "Душегуб", который отныне является корпоративным софтом, научили переносить сознания людей в двух режимах: быстро и не очень качественно, и медленно, но весьма детально. В первом случае получившийся индивид выходил вялым и медлительным, с кучей глюков и прочими "прелестями", а вторая услуга, которая стоила намного дороже, позволяла, по сути, получить новую версию уже рожденного человека, способного прожить еще одну полноценную жизнь.
Что касается сознания Джонни Сильверхенда, то его оцифровали качественно и с вниманием к деталям. В дальнейшем личность рокера перекочевала на небольшую флешку, за которую в будущем развернулась нешуточная война.