По данным "молекулярных часов", а также по данным генетики и молекулярной биологии, представители типа Хордовые отделились от остального древа царства Животные задолго до кембрийского периода, когда были найдены точно подтверждённые представители этого типа. И если предки червей, моллюсков и членистоногих худо-бедно прослеживаются в докембрии, то с предками хордовых там как-то туговато.
Если изначально хордовых выводили из каких-то групп кольчатых червей или моллюсков (а то и из примитивных членистоногих), то по современным данным вовсе не получается такой простой и ясной картины. Уж слишком много расхождений даже в эмбриональном развитии между теми же кольчецами, моллюсками и членистоногими с одной стороны и хордовыми (а также иглокожими и полухордовыми) - с другой. Что и говорить про особенности анатомии и физиологии.
По всей видимости, вторичноротые животные (хордовые, полухордовые, иглокожие) произошли независимо от первичноротых (почти все остальные) от каких-то примитивных плоских червей или, вообще, от особой группы стрекающих, а то и гребневиков. В общем, тайна, покрытая мраком, которую при современных методах исследования пока выяснить невозможно. Версии о происхождении хордовых от свободноплавающих личинок полухордовых и иглокожих не подтверждается "молекулярными часами", которые говорят, что хордовые и прочие вторичноротые разделились почти 600 млн. лет назад и имеют различное происхождение.
А ещё очень интересно то, что хордовые очень сильно отличаются не только от первичноротых, но и от прочих вторичноротых животных. Такое впечатление, что хордовых просто перевернули вверх ногами. То, что у "нормальных" животных является собственно "животом", у хордовых представляет собой условную "спину". Плюс очень своеобразные органы дыхания, движения, "оригинальная" кровеносная система и не имеющая аналогов в животном мире система нервная (хотя что-то подобное создали высокоразвитые моллюски, вроде головоногих).
Искренне надеюсь, что тайны происхождения хордовых будут со временем раскрыты. А я пока буду рассказывать про них (хордовых) поподробнее. Удачного дня!