Птицеводство — перспективная отрасль, вносящая существенный вклад в обеспечение человечества протеином. Исследования микробиома желудочно-кишечного тракта птицы показывают его влияние на здоровье и продуктивность. Микробиом регулирует физиологические функции, такие как, например, переваривание питательных веществ и развитие иммунной системы. Он может оказывать как положительное (исключение патогенных бактерий, расщепление полисахаридов, синтез жирных кислот), так и отрицательное (влияние на иммунную систему, конкуренция за питательные вещества) воздействие на процесс пищеварения хозяина.
Изучение микробиоты показало, что ее состав меняется в зависимости от возраста, пола и корма. Микробиом становится более стабильным и однородным на определенных этапах развития. Некоторые бактерии могут служить биомаркерами для состояний и заболеваний птицы. Компания «Каргилл» проводит исследования микробиоты кишечника и устанавливает связь между ингредиентами корма и преобладанием определенных бактерий. База данных и программное обеспечение разработаны для расшифровки результатов ДНК-анализа микробиоты. Идея управления микробиотой пищеварительной системы основана на регулировании кормовых субстратов для полезных и вредных бактерий. Для этого необходимо анализировать образцы микробиоты и корректировать рецептуры корма на основе полученных результатов, что может привести к улучшению продуктивности птицы.
Проведен полевой эксперимент с бройлерами, направленный на улучшение качества лап и снижение пододерматитов. Анализ микробиоты кишечника показал, что на площадках с плохими показателями доминировали Lactobacillaceae и было больше Campylobacteraceae, указывающих на риск качества и безопасности продукции. На благополучных площадках было меньше этих бактерий, но доминировали Bifidobacteriaceae, отвечающие за выработку полезных веществ в кишечнике. На основе полученных данных была разработана рецептура для снижения количества ферментируемых углеводов, субстратов для Lactobacillaceae, и проведены действия по снижению контаминации Campylobacteraceae. Анализ микробиоты кишечника является мощным инструментом в руках специалистов, позволяющим управлять продуктивностью через работу с микрофлорой кишечника и выбрать стратегию для снижения пододерматитов и/или антибиотиков в кормах.