Сергей Агеев родился 6 июля 1972 года в поселке Нарым Парабельского района Томской области, там же окончил среднюю школу, затем поступил в метеорологическое училище в Новосибирске. В 1990 году пошел в армию, где служил в военно-морском флоте в Североморске, после срочной службы вернулся в Парабель, где пошел работать в полицию.
С 1995 года Агеев начал заниматься коммерческой деятельностью в сфере торговли, с 1997 — занялся заготовкой леса и строительством.
Также бизнесмен окончил Новосибирский государственный аграрный университет по специальности «юриспруденция».
Позже активно занимался политической деятельностью, с 2007 по 2011 годы был депутатом областной думы, состоял в комитете по экономической политике. Награжден почетной грамотой региональной думы за особый вклад в социально-экономическое развитие Томской области и активную законотворческую деятельность. Агеев также был кандидатом в депутаты Госдумы.
Под контролем Агеева было несколько компаний, которые называли «Северной группой», он являлся гендиректором строительной организации ООО «Сибстройнефть», специализирующейся на строительстве магистральных нефте- и газопроводов. Затем дела пошли под гору, многие компании были ликвидированы, а сам Агеев был признан банкротом.
Напомним, источники сообщили о задержании Сергея Агеева, он проходит обвиняемым в деле о взятке вместе с экс-главой Томского района Александром Терещенко.