Батухан был сыном Чингисхана, великого монгольского вождя, и его первой жены, Бортейчин. Известно, что он был рожден в 1182 году, однако мало информации о его жизни до 1205 года. В 1205 году Батухан был отправлен отцом на поход в Китай, где он возглавлял одну из частей монгольской армии. В то время Чингисхану уже удалось завоевать значительную часть Северного Китая, однако он не смог взять Пекин и решил отправить своего сына, чтобы завершить победу. Батухан успешно завоевал Пекин, после чего вернулся к отцу, который приказал ему отправиться в Западную Азию на поход против хорезмийцев. Батухан возглавил одну из частей монгольской армии, которая участвовала в завоевании городов и территорий в Средней Азии. В 1227 году Чингисхан умер, и его империя была разделена между его четырьмя сыновьями, включая Батухана. Батухан унаследовал часть империи, которая включала в себя Китай и Монголию. Однако в 1235 году Батухан был убит своим сыном, Туле, который жаждал власти и наследования империи.