Версия по теории русловых названий(ТРН).
Город Шуя, не имеет внятной версии о происхождении названия, как и большинство других русских городов. Происхождение от слова "шуйца" левый, левая, вообще считаю церковным вбросом, так как само это слово нигде не употреблялось, кроме как в нескольких произведениях и то, явно не в тему, то есть за денежку. Можно предположить, что церковь сознательно пыталась ввести слова: болгарское "десница"(якобы правый) и шуйца(якобы левый) в пику старым русским словам, относящимся к старой религии. Вероятно эти слова и были: правь-правый(старый), явь-левый( который сейчас) болгарское- "наляво"; навь-будущий( то что будет). Эти три понятия относятся к славянскому коловрату трёх северных созвездий, славянских богов. Созвездия вращаются по кругу, против часовой стрелки, то есть двигаются налево-явь, уходя от прави-прошлое, то что будет- это навь, будущее.
Но всё таки пропихнули похожее на "явь" болгарское слово "наляво". Не по этому ли в деревнях рисовали львов на мебели, которые никогда здесь не водились, в память о старых богах?
Но мы отвлеклись. Шуя к "шуйцу" не имеет отношения. Скорее всего Шуя это изменнное слово Шея. Город в долине между двух речек.
Деревни Шеино в России есть и совпадают на местности со своими названиями, несколько Шуйских также имеют "шеи" в виде изгиба русла.
Шеино, Белгородская область, сухое пространство между "плечами" водоёмов
Шейно, Вологодская область, пример того, как один и тот же поворот реки можно было назвать по разному: Шейно, Калачёво или просто Гора
Шеино, Ярославская область
Шуино, Ярославская область, не имеет никаких признаков или даже ручьёв, возможно позднее название, связанное с фамилией
Шуйская Слобода, Петрозаводск, "шея без головы", но возможно и залив у Соломенного
Шуйская Чупа, Карелия, длинный, как шея, полуостров
Шуйское, Вологодская область, тут "шея" у Сухоны, а также две речки, впадающие в эту "шею": Шуя, Шейбухта, образуют такое же междуречье, как в городе Шуя
Шуйское, Казахстан, типичная "шея" без головы
Деревня Шуйское, Смоленская область, "шеи" на местной речке.
Вопрос: является ли Шуя- старым словом шея или это сознательная подмена, остаётся открытым.