Посреди каменистого пейзажа на фоне грозового неба, типичного для большинства картин Эль Греко зрелого и позднего периодов и порождающего ощущение сильной тревоги и грядущей опасности, святые Иоанн Креститель и Франциск Ассизский ведут оживленный и, похоже, задушевный диалог
Диалог между двумя персонажами передан Эль Греко в традиционной для художника манере - с помощью жестов рук персонажей
Иоанн Креститель, предполагаемый предшественник Мессии, покрыт верблюжьей шкурой, которую он пользовался в своем убежище в Иудейской пустыне. Аскетичность и очевидная изможденность Иоанна - следствие перенесенных им там физических тягот, истощивших его физически, однако закаливших духовно
Образ Крестителя сопровождается двумя символами, имеющими непосредственное отношение к Христу: тростниковым крестом и ягненком, указывающим на искупительную миссию Иисуса: AGNUS DEI (Агнца Божьего), которому предстоит стать жертвой во имя спасения грешного и неблагодарного человечества