В 1999 году модель Eclipse была представлена в третьем поколении, основанном на дизайне Mitsubishi SST, впервые продемонстрированном на Североамериканском международном автосалоне 1998 года. Это был первый концепт-кар, представленный компанией Mitsubishi на автосалоне в США.[16] Были доступны два новых варианта силовых агрегатов: 147-сильный (110 кВт) 2,4-литровый 16-клапанный SOHC I4 4G64 и 205-сильный (153 кВт) 24-клапанный SOHC 3,0-литровый V6 (6G72). Полный привод больше не предлагался. Настройки подвески были изменены для обеспечения более мягкой и комфортной езды. Eclipse третьего поколения поделился своей силовой установкой с Galant восьмого поколения. В конце 2001 года мощность GT trim была снижена до 200 л.с. (149 кВт) в результате ужесточения стандартов выбросов, вынудивших MMNA принять калифорнийские стандарты выбросов для всех вариантов автомобиля, вместо того чтобы продавать независимые версии "Federal Specification" и "California Specifications".