Александр Ярославич Невский скончался 14 ноября 1263 года и был похоронен в городе Владимире в монастыре Рождества Богородицы.
23 мая 1491 года сгорел весь город Владимир вместе с посадами, монастырём и церковью, в которой находились мощи Александра Невского. Согласно летописному своду 1497 года, во время этого пожара тело князя великого Александра Невского не сгорело. Церковь была отстроена заново и мощи были переложены в раку.
В 1681 году внутри церкви, где находились мощи, вновь произошёл пожар. Сгорели все иконы внутри церкви. После этого пожара 21 мая 1681 года мощи были собраны.В 1697 году митрополит Иларион поместил мощи в новую раку, украшенную резьбой и покрытую драгоценным покровом.
4 июля 1723 года, после окончания Северной войны , Петр Великий приказал перенести мощи из Владимира в Санкт-Петербург.Вывезенные из Владимира 11 августа 1723 года мощи были привезены в Шлиссельбург 20 сентября 1723 года.
В Шлиссельбурге мощи были установлены в специальном павильоне. Во время нахождения мощей внутри павильона случился пожар и павильон сгорел.
30 августа 1724 года нетленные мощи были установлены в Александро-Невской лавре.При освящении в монастыре в 1790 году Троицкого собора мощи положены в нём в серебряной раке, пожертвованной императрицей Елизаветой Петровной в 1753 году, на изготовление которой мастерами Сестрорецкого завода пошло около 90 пудов серебра . В 1790 году после завершения строительства собора Пресвятой Троицы гробница была перенесена в этот собор и размещена за правым клиросом
После Февральской революции 24 июля 1917 года Синодальная комиссия осуществила вскрытие раки с мощами и освидетельствовала мощи.Результат вскрытия был шокирующий:
Вся передняя часть головы и лоб оказались сделанными искусственно и вылепленными из воска, только небольшая верхняя часть — часть черепа подлинно-серого цвета. Грудь и живот оказались тоже искусственными из ваты, зашитой в шелковые мешки. С прибавлением ваты оказались ноги и руки, т. к. подлинных костей было мало. Чучело князя, в которое были помещены подлинные мощи, именно часть черепа и части костей, рук и ног и два ребра лежало на деревянной настилке, покрытой в несколько рядов тканями, так что ножки гроба оказались очень длинными. На чучеле у боков оказался мешочек шелковый: с костями — мелкими в бумажке, с ароматическими веществами в виде порошка в другой. На бумаге с этими мелкими костями есть надпись, указывающая, что мощи были в церкви, подвергшейся пожару, при коем в этой церкви сгорели все деревянные образа(189 [1681] мая в 20 день собраны сия мощи благовернаго князя Александра после церковнаго горения, тогда бо погореша вси иконы)
О результате вскрытия было доложено , после чего из раки были убраны посторонние предметы и оставлены только кости.
12 мая 1922 года Советская власть осуществила вскрытие раки с мощами в присутствии около 300 человек, среди которых был митрополит Вениамин вместе с православным духовенством; содержимое раки было запечатлено несколькими фотографами, а также заснято на киноленту.
При вскрытии было обнаружено 12 небольших костей разного цвета значит от разных мощей. К тому же в раке оказалось 2 одинаковые кости одной правой ноги.2 августа 1922 года вновь сформированная экспертная группа которая сделала экспертизу: В составе мощей имеются несколько костей и обломков их и полуобгоревшие кусочки костей, перемешенные с частицами почвы и обгоревшими кусочками дерева. В числе костей имеются: одно целое ребро и два обломка ребер, правое бедро 41 см длины; левая плечевая кость, 28½ см; правая и левая малоберцовые кости, обе по 33 см длины, один грудной позвонок; каменные части обеих височных костей; далее имеются обломки нижеследующих костей: бедро; крестцы затылочной кости; малой берцовой кости, части черепного свода, вышеупомянутые кусочки кости частично полуобгорелые и размеров не свыше 1½–2-х см. Все упомянутые цельные кости и обломки принадлежат с несомненностью скелету человека. По внешнему виду кости древнего происхождения. В числе костей имеются обломки малой берцовой кости другого человека.
Советской властью было открыто уголовное делов связи с обманом что сотни лет тело князя считали нетленным, а по факту были обнаружены сгоревшие кости.Таким образом частично останки князя Александра Невского сгорели в 1491 году во время пожара, испепелившего весь Владимир вместе с монастырем, где эти останки находились и окончательно подверглись пожару в 1681 году. По указанию Петра Великого было сконструировано тело в которое были помещены настоящие останки с чужой берцовой костью, но все это было сделано тайно.Существует легенда что когда Петр Великий увидел то что осталось от нетленных мощей, он приказал ключ от раки выбросить в Неву чтобы об этой тайне никто не узнал.
В настоящее время мощи благоверного князя Александра Невского находятся в раке в Свято-Троицком соборе Александро-Невской Лавры, на крышке раки находятся семьдесят девять частиц мощей святых.