Первая инстанция, Южный окружной военный суд, признала Музраева виновными, назначив ему наказание в виде 20 лет лишения свободы, которые он продолжает отбывать в условиях строгого режима. Также он был лишен звания и всех удостоившихся в процессе работы государственных наград. Осенью 2023 дело Музраева засекретили, а в ноябре стало известно, что приговор все же пересматривался. Смягчить его для экс-главы СКР не удалось, он вступил в законную силу.
В июне этого года лишенный звания Музраев решил оспорить приговор, признающий его виновным в теракте с попыткой поджога дома губернатор Андрея Бочарова. Была подана кассационная жалоба.
На момент возбуждения уголовного дела он являлся советником председателя СКР Александра Бастрыкина, находился в звании генерал-лейтенанта юстиции, был обвинен, в частности, в организации поджога дома губернатора Андрея Бочарова и «крышевании» волгоградских «авторитетов», а также хранении патронов. Уголовное дело на него квалифицировали по статьям «Тер