В 1994 году впервые была образована Третья лига. Команды соревновались в ней в шести зонах. На Дальнем Востоке и Сибири турниров в Третьей лиге не проводилось, так как не было в этом необходимости. Во всех шести зонах по две команды получали право подняться во Вторую, но выступающие в Третьей лиге дублирующие составы клубов из более высоких лиг не имели такого права.
1 зона
Турнир начали 18 команд, но уже в начале июня большие проблемы появились у Химика. Сначала они перенесли выездные матчи, но вскоре просто снялись с турнира, хотя на этот момент по потерянным очкам шли наравне с лидером.
После аннулирования результатов Химика таблица немного изменилась
После первого круга снялась Дружба, а еще через пару туров Гигант.
За путевки во Вторую лигу борьба шла постоянно, но Автозапчасть шла впереди почти с самого старта, Энергия также заблаговременно завоевала путевку во Вторую лигу, но уже перед самым финишем.
2 зона
Сначала в зоне должно было играть 18 команд, но перед стартом Искру Смоленск перевели в 4 зону.
Волгарь к середине мая вошел в группу лидеров и больше из нее не выходил. Иногда только астраханская команда опускалась на третье место, но быстро возвращалась наверх.
Команда Кристалл Дятьково была исключена из лиги после 24 игр. Ей засчитаны поражения со счётом 0:3 в оставшихся матчах, а соперникам — победа с таким счётом.
За второе место борьба шла до самого последнего тура. Ростовские армейцы только по дополнительным показателям в итоге обошли Источник.
3 зона
В третьей зоне играли 24 команды, поэтому календарь матчей был очень насыщен. Тон задавали весь год три команды: Спартак-д, Спартак Щелково и Сатурн. В итоге не особо стало важным, кому какое место занимать в этой тройке, так как Спартак-д в Третьей лиге все равно оставался.
4 зона
Незадолго до начала первенства снялись с соревнований 3 команды. Руководителями ПФЛ был перекроен календарь с добавлением смоленской «Искры», которая изначально находилась среди участников турнира 2 зоны.
Снявшимся после 1 круга Весту и Зениту-д сначала были засчитаны технические поражения со счётом 0:3 в оставшихся матчах (как того требует регламент, если командами проведено не менее 50 % матчей), но затем в ПФЛ были обнаружены нарушения регламента в части принятия данного решения (команды не успели провести половину игр), и результаты игр с их участием были аннулированы.
В первом круге лучше других выступали ЦСК ВВС Кристалл, Гатчина и Буран. Они и расположились на верхних строчках по его итогам. Компанию им составил еще Машиностроитель.
После снятия двух команд таблица несколько изменила свой вид.
К концу сезона Машиностроитель и Буран чуть сбавили темп и пришли к финишу далеко позади команд из Смоленска и Гатчины.
5 зона
В 5 зоне 17 команд вышли на старт, столько же и пришло к финишу, что уже в некотором роде можно считать достижением.
Очень быстро на первую строчку взошла команда СКД Самара. Никто конкуренцию ей составить так и не смог.
Настоящая борьба развернулась за третье место, так как на втором также быстро закрепился Сокол-д.
В самом начале сентября на него попало Торпедо Павлово. На финише команда смогла оторваться от конкурентов и близко к себе не подпустить.
6 зона
В шестой зоне команд было не много, никто не сошел с пути по ходу чемпионата.
Темп задавала Сибирь Курган. Неплохо играл в первом круге Метизник, но команда для лидера слишком часто завершала свои матчи мирным исходом в первом круге.
К концу первого круга Эстель Уфа обошла Метизник.
Уже на самом финише Метизник обошел Зенит и финишировал вторым, но во Вторую лигу вышел Зенит.