Статья подготовлена изданием Лаборант - журнал об аналитической химии. Подписывайтесь так же на нашу научную папку в телеграм.
Геном человека содержит около 20 000 генов, кодирующих белки, что составляет лишь около двух процентов всего генома. Долгие годы учёным было проще игнорировать весь этот дополнительный генетический материал, который считался "мусорной ДНК" без определённой функции. Однако в последние десятилетия важность некоторых участков некодирующей ДНК становится всё более очевидной, особенно с развитием генетических и вычислительных инструментов.
Согласно исследованию, опубликованному в журнале Cell, учёные определили сотни важнейших длинных некодирующих РНК (днкРНК), которые транскрибируются из ДНК и играют важную биологическую роль в клетках. Некоторые из этих днкРНК участвуют в развитии человека, другие связаны с раком, что показывает широкий спектр их влияния.
В исследовании учёные использовали инструмент редактирования генов CRISPR для удаления различных генетических последовательностей и идентифицировали около 800 некодирующих РНК в различных типах клеток и тканей. Вместо традиционного фермента Cas9 они использовали фермент Cas13, который разрезает РНК, что позволило напрямую воздействовать на молекулы РНК, не нарушая регуляторные элементы в ДНК.
Исследователи проанализировали около 6200 пар днкРНК и кодирующих белок генов в пяти различных типах клеток. Это позволило выявить 778 днкРНК, критически важных для нормального функционирования различных клеток, включая 46 essential днкРНК, необходимых для работы всех типов клеток, и 732 днкРНК, специализированных для конкретных типов клеток.
Многие важные днкРНК экспрессируются на стадиях развития, с понижением уровня экспрессии по мере развития. Эти essential днкРНК помогают контролировать различные пути, связанные с ростом клеток, что важно как для развития, так и для понимания рака.
"Эти некодирующие РНК могут стать новыми биомаркерами и терапевтическими мишенями для лечения рака, что открывает возможности для персонализированной медицины", - добавил Санджана.
Источники:
- Cell
Статья подготовлена изданием Лаборант - журнал об аналитической химии. Подписывайтесь так же на нашу научную папку в телеграм.