Сталкер Скиф отправляется в Зону после того, как аномалия сожгла его дом и выплюнула угасший артефакт. Он хочет восстановить артефакт с помощью специального прибора и разбогатеть, однако все идет не по плану: на героя нападает милитаризованная группа, артефакт и Сканер (тот самый прибор) уносят с собой. Скиф решает пуститься на поиски — дома ему бомжом делать нечего. Изучая наводки, он узнает, что Сканер был не один. Эта новейшая разработка НИИЧАЗ, позволяющая управлять аномальной энергией, стала достоянием общественности. Сталкеры получили доступ к рабочим образцам и творят с ними что хотят. Попутно Скиф знакомится с группой бывших монолитовцев под предводительством Бродяги — старого знакомого из «Зова Припяти». Они называют себя «Полдень» и хотят избавиться от дурного прошлого — хотя после зомбификации потеряли всю память. Также Скиф знакомится со Шрамом, протагонистом «Чистого Неба», а ныне — легендой Зоны, который позже сыграет важную роль в сюжете. Бродяга и Шрам действуют заодн