В силурийском периоде бесчелюстные начали уступать позиции новой группе: панцирным рыбам. У них уже были настоящие челюсти, хотя и отличающиеся от челюстей современных классов рыб. Такая разница объясняется возможным происхождением ротового аппарата плакодерм от жаберных дуг бесчелюстных.
Панцирные рыбы были очень многообразной группой: среди них встречались как донные фильтраторы, так и гигантские хищники. Наибольших размеров достиг отряд артродир в лице десятиметрового дунклеостея, система мышц которого позволяла открыть рот во всю ширину за пять сотых секунды. Это создавало ток воды такой мощности, что жертву буквально затягивало в пасть. Однако и среди других групп плакодерм есть интересные виды, например загадочный палеоспондил, достигавший 6 сантиметров в длину. Вполне возможно, что это всего лишь личинка. Из фильтраторов можно выделить ботриолеписов: род, включающий более 100 видов. Они жили в реках и озёрах по всему миру и в среднем достигали длины около тридцати сантиметров. К сожалению, все плакодермы вымерли в конце девонского периода, однако некоторые учёные считают, что они являются предками всех остальных классов рыб.