С 1931 по 1938 г. – руководил клиникой психиатрии института усовершенствования врачей при Психиатрической больнице св. Николая Чудотворца.
Творческое наследие К. Поварнина насчитывает свыше 50 научных работ, под его руководством было защищено около 40 диссертаций. Константин Иннокентьевич Поварнин состоял действительным членом «Русского общества нормальной и патологической психологии», «Научных собраний врачей клиники душевных и нервных болезней», «Санкт-Петербургского Общества психиатров», «Общества по дошкольному воспитанию», являлся организатором Всероссийских съездов по семейному воспитанию, был редактором журналов «Вестник криминальной антропологии и гипнотизма» и «Журнала для усовершенствования врачей», являлся членом Международной лиги по борьбе с эпилепсией.
Наиболее значимые труды
Поварнин К.И. Педологические институты и их роль в науке и практике / Проф. К.И. Поварнин. - Петроград : тип. т-ва "Наш век", 1916. - 23 с. ; 17 см.
Поварнин К.И. Материалы к вопросу об эскпериментально-психологическом исследовании душевнобольных : [Докл. в заседании О-ва психиатров в Петрограде 30 апр. 1916 г.] / Проф. К.И. Поварнин. - Петроград : тип. Больницы Всех Скорбящих, 1917. - 36 с. ; 24 см.
Поварнин К.И. К сорокалетию Государственного института для усовершенствования врачей : [1885-1925 гг.] / [Соч.] проф. К.И.Поварнина. - Л. : Тип. им. Гутенберга, [1925]. - 10 с. : ил. ; 27 см.
Поварнин К.И. Внимание и его роль в простейших психических процессах : (Эксперим.-психол. исслед.) : Дис. на степ. д-ра мед. К.И. Поварнина / Из Психол. лаб. акад. В.М. Бехтерева. - Санкт-Петербург : тип. В.Я. Мильштейна, 1906. - 274 с. : ил. ; 22 см.. - (Серия докторских диссертаций, допущенных к защите в Военно-медицинской академии в 1905-1906 учебном году ; № 5). - Библиогр. в примеч.