Кроме органов исполнительной, законодательной и судебной власти действуют также ряд организаций, которые самостоятельно и независимо выполняют соответствующие функции.
Конституционный Суд Республики Корея – это независимый и специализированный суд. Его основная роль заключается в проверке соответствия Конституции Республики Корея отдельных законов и нормативных актов в сочетании с выполнением функций административного права, такими как принятие окончательных решений об импичменте и вынесение решений о роспуске политических партий. Конституционный Суд состоит из девяти судей, из которых по три судьи назначают Президент, Национальное Собрание и председатель Верховного Суда. Председателя Конституционного Суда назначает Президент с согласия Национального Собрания.
Национальная избирательная комиссия является независимым конституционным органом, основными задачами которого являются управление выборами на государственные должности и делами, связанными с политическими партиями и политическими фондами. Срок полномочий членов Комиссии составляет шесть лет, и они не могут вступать в политические партии и участвовать в политической деятельности. Председатель избирается из числа членов Комиссии.
Корейская национальная комиссия по правам человека – это независимый коллегиальный орган, деятельность которого направлена на защиту, отстаивание и продвижение основных прав человека с целью обеспечить уважение достоинства и ценность людей как суверенных личностей. Комиссия была создана в ноябре 2001 года, чтобы отразить искреннее желание людей улучшить положение с правами человека в стране, выраженное в ходе прошлого процесса демократизации. Комиссия также рассматривает дела, связанные с нарушением прав человека или дискриминацией в отношении иностранцев, постоянно проживающих или работающих в Южной Корее.