И так, предыдущую тему (Введение: что такое аутосомные и модальные компоненты.) мы закончили на том что правильный граф адмикстур должен содержать в себе остов дерева Y-гаплогрупп, именно такие модели больше всего получаются соответствующими действительности.
Действительно, в программе qpGraph человек как бы сам рисует граф, а программа рассчитывает для него коэффициенты и выдает некий индекс правдоподобности. Для выбора близкого к действительности графа нужно нарисовать десятки, а то и сотни графов. Понятно, что они рисуются по представлениям человека и содержат массу ошибок, ведь вариантов множество, а человек животное ошибающееся. Вот один из таких графов из последнего препринта Allentoft et al. POPULATION GENOMICS OF STONE AGE EURASIA с добавленными мной Y-гаплогруппами.
Видно что он содержит в себе некий остов дерева Y-гаплогрупп, так получилось у них в результате массового генерирования разных вариантов графа, но на нем масса ошибок связанных с неверной интерпретацией данных. Усть-Ишим у них оказался в Восточной Евразии, в то время как в нем нет ничего восточноазиатского, он существовал до геномного разделения на восточную и западную Евразию. А вот C1a у них попал в Западную Евразию, в то время как аутосомно наиболее близкий к ориньякцу ГоетуQ116-2 образец из северовосточного Китая того же времени Тяньюань, у которого есть восточноазиатский сдвиг. Тоже самое касается перевернутых стрелок, некоторые потоки шли в обратную, например в Иран был поток из ANE (R2a), но не к ANE (R).
Надо сказать что рассчитать такой граф как показано на верхнем рисунке сейчас вряд ли возможно, он слишком сложный, в нем не хватает множество еще не открытых или неопубликованных образцов. ведь на графе Алентофта есть например еще неопубликованный образец с Кавказа верхнего палеолита из Котиас, по которому есть надежда о его скорой публикации, в отличии от другого образца с Кавказа верхнего палеолита из Дзудзуаны, по которому нет надежды.
#наука #палеогенетика #генетика #ДНК-генеалогия #гаплогруппы #гаплогруппа