7 сентября 2007 года - образован Следственный комитет при прокуратуре России. Из компетенции прокурора исключены полномочия по процессуальному руководству следствием и созданы условия для полной независимости следственного аппарата.
Вновь созданный Следственный комитет входил в систему органов прокуратуры. Однако уже тогда Председатель СК при прокуратуре утверждал структуру и расписание ведомства, а также определял полномочия его подразделений.
Включенность в органы прокуратуры носила формально-правовой характер. Вместе с тем это стало отправной точкой для увеличения эффективности реализации полномочий прокуроров по надзору за процессуальной деятельностью органов предварительного следствия и повышения их объективности.
С тех пор ведомство претерпело ряд изменений, в 2011 году став самостоятельной структурой, что позволило вывести работу следственных органов на новый уровень.
За 15 лет Следственным комитетом направлено в суд более 1,4 миллиона уголовных дел, в том числе 128 тысяч дел о коррупции. Во взаимодействии с органами МВД и ФСБ России раскрыта 91 тысяча преступлений прошлых лет, в том числе 10 тысяч убийств. Гражданам и государству возмещен причиненный преступлениями ущерб на сумму, превышающую 685 миллиардов рублей. Кроме того, в ходе следствия наложен арест на имущество обвиняемых стоимостью почти 460 миллиардов рублей.
В настоящее время СК России в своей деятельности независим от других органов исполнительной власти, общественных объединений и организаций.