Переменное электрическое поле волны возбуждает индукционные токи в проводящих тканях организма. При достаточно низких частотах (менее 1 МГц) на мышцы и нервы воздействуют сами эти токи. А при более высоких частотах механизмом воздействия становится нагревание тканей индукционными токами - подобно тому как индукционная плита нагревает кастрюлю. Организм спасается от перегрева путём дополнительного притока крови к нагретым тканям. Но в некоторых органах кровеносных сосудов очень мало и этот механизм терморегуляции не срабатывает. Так, хрусталик лишён кровеносных сосудов, и СВЧ-облучение может привести к его помутнению или разрушению. По той же причине уязвимы для микроволн мозг, желчный пузырь, мочевой пузырь и жкт.
Тепловой механизм СВЧ-излучений сомнений не вызывает. Но многие учённые убеждены что, существует ещё специфическое нетепловое воздействие. Механизм его мало изучен. Но исследования проведённые в СССР ещё в 1980-ых годах, показали что даже при отсутствии заметного теплового воздействия радиоволны могут вызывать нервные расстройства (повышенную утомляемость,бессонницу, депрессивные состояния), а также нарушения функций сердечно-сосудистой системы и обмена веществ. Есть подозрения, что СВЧ-излучения подавляют выработку Т-киллеров, главной функцией которых является уничтожение повреждённых клеток организма, а такое подавление является прямым путём к раку. СВЧ-излучение ослабляют также клеточные мембраны, облегчая вирусам и прочим микроорганизмам проникновение в клетки.