Иван Михайлович Ковшаров родился в 1878 г. в Одессе в мещанской семье. Иван Михайлович окончил Одесский университет, получив профессию адвоката, затем жил в Санкт-Петербурге. Здесь будущий мученик был помощником адвоката, затем присяжным поверенным Санкт-Петербургского округа Судебной палаты. Будучи глубоко верующим человеком, Иван Михайлович старался направлять свои знания на пользу Православной Церкви. Он являлся юрисконсультом Александро-Невской лавры, в 1916 г. вошел в Правление Общества объединенных петроградских приходов.
После большевистского переворота Иван Михайлович защищал храмы от закрытия, а священнослужителей - от советского произвола. В 1918 г. мученик Иоанн был избран комиссаром по епархиальным делам «для представительства и защиты общих прав и интересов» Петроградской епархии.
Неудивительно, что недоброжелателей среди представителей безбожной власти у Ивана Михайловича набралось немало. Ленин, Дзержинский и им подобные ненавидели адвокатов и возмущались тем, что из-за них возникают задержки в деле вынесения приговоров. Намного проще была революционная система, когда следователь порой выступал и в качестве судьи, и в качестве палача. А потому судьба мученика Иоанна была предрешена.
В 1922 г. на фоне спровоцированного большевиками голода Церковь подверглась очередному ограблению. Митрополит Петроградский Вениамин был готов к передаче церковных ценностей, но настаивал, что Церковь должна следить за их судьбой. Святитель оказался прав - на нужны голодающих ценности так и не пошли.
Воспользовавшись стихийными народными протестами, большевики притупили к репрессиям. «Чем большее число представителей реакционной буржуазии и реакционно настроенного духовенства удастся нам по этому поводу расстрелять, тем лучше» - направлял волну террора «великий гуманист» Ленин.
В 1922 г. был арестован и Иван Михайлович Ковшаров. На петроградском процессе он подробно разбирал пункты обвинения и давал на них хладнокровные и меткие ответы.
На вопрос судьи, чем он занимался до революции 1917 года, святой ответил: «Да вас защищал».
«Общественный обвинитель Смирнов, - сказал Иван Михайлович, - неоднократно называл нас здесь лжецами, лицемерами, обманщиками. Но он нас должен был бы назвать сумасшедшими, если бы мы вздумали начать войну с советской властью с целью ее свержения с армией баб и подростков. И это после того, как эту власть не могли свергнуть вооруженные организованные армии Колчака, Деникина, Юденича».
В ответ на требование 16 смертных приговоров святой ответил: «Грозящее наказание никак не может находится в соответствии с теми данными, которыми располагает обвинение… Для братской могилы в шестнадцать человек материала для обвинения мало».
Возможно, своими словами Иван Михайлович помог тому, что большинство смертных приговоров не было утверждено. К расстрелу в конечном итоге были приговорены митрополит Вениамин, архимандрит Сергий (Шеин) и миряне - Юрий Новицкий и сам Иоанн Ковшаров.
В ночь на 13 августа 1922 г. страдальцы, обритые и одетые в лохмотья (чтобы их не опознали и не отбили у конвоя), были расстреляны. Точное место расстрела не установлено до сих пор.