Действия этой части серии происходят далеко за пределами Земли. Жителям Земли не хватало ресурсов и ископаемых, поэтому они были вынуждены искать их в космосе, на других планетах Солнечной системы. Все проходило отлично, пока на Марсе не появилось движение колонизаторов-повстанцев, которые жаждут власти. Движение, называющие себя Фронтом Обороны Колоний или СДФ, начало длительную войну с Землей, надеясь захватить ее в свои руки.
Протекает 2180 год. На Европу, спутник Юпитера, выдвинулась группа бойцов спецподразделения SCAR для того, чтобы узнать почему произошла внезапная потеря связи с военным объектном SATO. По прибытию группа обнаруживает, что объект захватили СДФ. Отряд решает уничтожить объект, а с ним и повстанцев, и прототип нового оружия. Они смогли провернуть уничтожение, но их быстро рассекретили. Они с боем пытаются эвакуироваться, но враги сбивают пилота самолета, а вскоре повреждают комплекс и из-за разгерметизации всех вытягивает наружу, где их, по приказу адмирала Салена Котча, лидера СДФ, убивают повстанцы.
После 18 часов тишины новость доходить до главнокомандующего SATO в Женеве - адмирала Фредерика Рейнза. Сразу же об это узнает и командир отряда SCAR - лейтенант Ник Рейес. Они обсуждают план нападения, а после лейтенант уходит на праздник Недели Флота, где встречается напарницу Нору Солдер и E3N - улучшенного тактического гуманоида, который приписан к экипажу. Праздник прерывается выстрелами орудий ААТИС, которые обороняют Женеву, по дружественному флоту. В этот же миг прибывают корабли СДФ и атакуют главную башню. Отряду SCAR удается вернуть контроль над орудиями и захватить взломавшего их оперативника СДФ Акил Мин Райя. Выйдя на земную орбиту, корабли САТО разбивают напавший вражеский флот, однако неожиданно появившийся суперкрейсер СДФ "Олимп" убивает всех. Из уцелевших кораблей остаются только "Возмездие" и "Тигр". Им удается отогнать "Олимп" подальше. Адмирал Рейз по связи просит выиграть немного времени для Земли, пока восстанавливают флот. После этого Рейес становится новым капитаном "Возмездия", заменяя погибшего Джона Олдера.
После приказа, все бойцы незамедлительно приступили к выполнению. Первая операция была проведена успешно: освобождение лунного порта ЮНСА и уничтожение вражеского корабля СДФ "Арес", с которого удалось получить карту с расположением всех вражеских кораблей. С этой картой "Возмездие" выполняет множество заданий на других планетах, после приступают к важной миссии - необходимо снизить боеспособность СДФ. "Возмездие" отправляется на спутник Сатурна Титан и уничтожают ключевую вражескую топливную базу сначала с боем, а потом просто с воздуха. Во время боя истребитель Рейеса подбивают и ему приходится катапультироваться. Капитана подбирает капитан Ферран с "Тигра" и возвращает на корабль, где он отправляется на другое задание.
Следующей миссией SCAR становится спасение шахтер с астероида Веста 3, который слишком опасен, так как сошел с орбиты и направляется к Солнцу. Найдя в шахтах рабочих, герои узнаю о том, что в смещении астероида виноват "Олимп", который сбил астероид и перепрограммировал роботов-охранников. При попытке спасти всех гражданских погибает штаб-сержант Омар. Вскоре узнается, что эта миссия была отвлекающим ходом СДФ, которые в этот момент уничтожили "Тигр". Капитан принимает решение - отомстить за уничтожение товарищей, заманив флот в Женеву. Основной целью стал оперативник Акил Мин Райя, в котором при осмотре обнаружили вживленный транспондер, передающий сигналы СДФ. Герои решают уничтожить маячок, вытащив его из тела и раздробив на мелкие куски. Из-за потери сигнала, СДФ прилетят в Женеву и будут повержены ААТИС. Но план практически проваливается - Райя умудряется сбежать и подорвать орудия, вытащить и уничтожить маячок, после всего умереть. Группе SCAR удается захватить крейсер и убить адмирала Салена Котча, а затем направить корабль в сторону Марса.
Группа решает использовать "Олимп" в качестве троянского коня, прорвать оборону и уничтожить орбитальную верфь, которая является важным стратегическим объектом. Рейес принимает решение протаранить верфь, но корабль из-за натиска падает на поверхность Марса и из-за этого погибает множество солдат. Отряд, теряя людей, добирается до космического лифта и поднимается к верфи. Группа отправляется захватывать вооруженный эсминец, а капитан Рейес - в штаб для его активации. Во время активации корабля погибает Итан, который жертвует собой и вытаскивает из ядра конденсатор, чтобы воспламенить его и освободить корабль. После активации корабля, капитан просит Солтер стрелять по его позиции. После долгих переговоров, она все же выполняет приказ. Рейеса уносит в открытый космос. Последним, что он успевает увидеть перед смертью - долгожданный взрыв верфи и прилетевший в его шлем осколок.