По аудиторному признаку японскую анимацию и комиксы можно разделить на несколько возрастных категорий.
Кодомо
— это манга и аниме для маленьких зрителей. Для кодомо характерны простые сюжеты и простая рисовка, главные герои обычно дети или животные. Такое аниме можно включать тем, кому еще не исполнилось 12 лет. К этой категории относятся такие мультсериалы, как «Приключения пчелки Майи» и «Покемон», а также полнометражные мультфильмы знаменитого японского аниматора Хаяо Миядзаки «Мой сосед Тоторо» и «Рыбка Поньо».
Сёнэн
— аниме и манга для юношей-подростков. В сёнэн раскрываются темы мужской дружбы и соперничества. Главный герой — молодой человек, храбрый и последовательно идущий к своей цели. Персонажей женского пола нередко рисуют преувеличено привлекательными, они обращают на себя внимание героя. Основные жанры аниме и манга категории сёнэн — комедия, приключения, фантастика. В качестве примера можно привести популярные по всему миру, в том числе и в России, аниме-сериалы «Наруто» и «Стальной алхимик».
Сёдзё
— аниме и манга для девушек-подростков. Главной героиней обычно является молодая девушка, а основными темами — становление личности и романтические отношения. В эту категорию попадает известное аниме «Сейлор Мун» о девушках со сверхъестественными способностями, которые борются со злом.
Сэйнэн
— аниме и манга для мужчин старше 18 лет. Для комиксов и аниме-сериалов, относящихся к категории сэйнэн, характерны сложные сюжеты, реалистичность рисунка и совсем не детские темы. Они отличаются большим жанровым разнообразием - от боевиков и фантастики до комедий и порнографии. Примером могут послужить фантастические полнометражные фильмы и манга «Призрак в доспехах».
Дзёсэй
— аниме и манга для взрослых женщин. Основной темой часто являются романтические отношения, но они описываются более реалистично, чем в сёдзё-аниме и манге. Также дзёсэй нередко обращается к темам брака, работы, семейных отношений. Из-за ориентации на взрослую аудиторию возможно наличие эротических сцен.
Также аниме можно разделить по жанровому признаку, и деление это во многом близко к делению кинематографа.
Упоминания заслуживают жанры хентай, яой и юри. Это аниме и манга эротического, а часто и порнографического содержания. Хентай описывает гетеросексуальные отношения, в то время как яой и юри — гомосексуальные. Предназначены такие комиксы и сериалы только для взрослых.
Немало аниме снято в таких жанрах, как боевик, ужасы, мистика, фэнтази. В них герои дерутся на мечах или устраивают перестрелки, проливаются литры крови. В фантастических и фэнтезийных мультсериалах присутствуют вампиры, упыри, оборотни, демоны и прочие сверхъестественные существа. Ориентированы подобные аниме, в основном, на мужскую аудиторию. Характерной их особенностью является чрезвычайная жестокость и обилие сцен насилия. Яркие примеры — опулярные аниме-сериалы «Hellsing», «Claymore» и особенно «Эльфийская песнь».
Не рекомендуются к просмотру для детей также аниме в жанрах киберпанк, фантастика и меха (аниме о человекоподобных машинах и роботах), поскольку в них обычно присутствуют сцены жестоких битв, как, например, в известном аниме «Евангелион».