Эдвард Киллингворт Джонсон родился в 1825 году то ли в Лондоне, то ли в Стратфорде (графство Эссекс) в семье купца ирландского происхождения. По крайней мере, его родители в молодости жили в Лондоне. Однажды Ричард Джонсон отправился, как обычно, по торговым делам, а когда вернулся, то узнал, что его жена Мэри Медоуз умерла от холеры. Забрав своих шестерых детей (младшему, Эдварду, было всего семь), он отвёз их на ферму Бейкер в Сибл-Хедингем, которую покойная Мэри получила в приданое. Три года, проведённые в сельской местности, где дети пользовались полной свободой, остались в памяти Эдварда как самые счастливые дни в его жизни. А потом умер отец и мальчика вместе с его братьями и сёстрами родственники забрали назад в Лондон. На дворе стояла викторианская эпоха и сироты вынуждены были трудиться, чтобы не быть обузой родне. Дядьями Эдварда были художник-маринист Джеймс Медоуз и иллюстратор Джон Мэйси Райт. Поэтому десятилетнего мальчика определили в ученики к гравёру по дереву Джону О