Благополучно пройдя через многочисленные испытания, и отправив хитроумного доктора Роботника в небытие, инопланетное существо в облике синего ёжика по имени Соник, наконец обрело покой, и настоящий дом, поскольку молодой шериф населенного пункта Грин-Хиллс Томас Вачовски и его очаровательная супруга Мэдди, решили его усыновить. К сожалению, от восторга и желания проявить себя, малыш использует свои уникальные способности не по делу, отчего наносит вред окружающей среде. Опекун советует ему не спешить, и сперва как следует адаптироваться к земным условиям. Когда супруги решают отдохнуть на курорте, герой остается на хозяйстве, и в первый же день его навещает ехидна Наклз, которая сообщает о проблеме, нависшей над всем человечеством. Дело в том, что вернувшийся из ссылки полубезумный Работник отправился на поиски могущественного "Мастера Изумруда", способного менять реальность, и если он до него доберется, последствия могут быть ужасными. Призвав на помощь верного друга, лисенка Майлза, герой отправляется в Восточную Сибирь, где в одном из древних храмов хранится магический компас, способный показать путь к артефакту. Простак и не подозревает, что хитрый доктор внимательно следит за всеми передвижениями экспедиции, рассчитывая отобрать Изумруд в нужный момент.