В 30-е годы научные изыскания профессоров и преподавателей института не ограничивались лишь написанием учебников и методических пособий. Географы института во главе с профессором Ш.С. Абзановым работали над изучением вопросов экономгеографии СССР, а также Башкирской АССР. Следует подчеркнуть, что Ш.С. Абзанов являлся автором 13 книг и многочисленных статей по физической и экономической географии, ему принадлежит большая заслуга в деле расширения научной работы в Башкирском пединституте. В 1934 г. вышел первый сборник научных трудов преподавателей под редакцией Ш.С Абзанова.
Автором более 100 научных трудов по геоботанике Южного Урала был А.К. Носков, выпускник Петербургского университета 1898 г., доцент БГПИ. Он три года руководил одним из геоботанических отрядов Башкирской экспедиции АН СССР. На географическом факультете он осуществлял выполнение тем: «К вопросу о засухе в Башкортостане», «Физико-географическое районирование БАССР». Учитывая его большую научную работу, Комитет по делам высшей школы СНК СССР в 1941 г. утвердил А.К. Носкова в ученой степени кандидата географических наук.
В состав факультета естествознания входили три кафедры: ботаники, зоологии и дарвинизма, химии.
Становлению факультета естествознания способствовало наличие высококвалифицированных научно-педагогических кадров таких как: доцент Г.Г. Штехер, один из крупнейших ученых–зоологов того времени, доцент И.Ш. Ишмухаметов был не только прекрасным педагогом, но и великолепным химиком-экспериментатором. Заведующий кафедрой ботаники доцент С.А. Баранов был крупным специалистом по изучению мхов, лишайников.
